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許多商業性公司可以提供合成肽，或商業化的試劑盒，或用于實驗室的合成儀。但都價格昂貴。
肽鏈的合成可以采用特制的聚乙烯大頭針作支持體的超微量固相多肽合成技術，在塑料微量滴定盒或在紙上進行。系列肽可以直接在固相支持物上用抗體檢測，或者從固相支持物上切割下來再進行分析。如果需要的只是對1～2種抗體識別的表位作圖，回答“是”或“不是”，那么該系統就已足夠，而且十分經濟。如果待測抗原是一個實驗室中的大項目，建議購買那種具有游離生物素結合的、在生物素和同源肽序列間有4個氨基酸間隙的肽。購買此種肽鏈一般是lmg，可用于4000次或更多的檢測分析。肽的濃度是經過親和檢測分析的；肽鏈的純度也是經過檢測的；該肽鏈具有足夠的量可供表面胞質共振分析、親和柱或作為免疫原用。
所謂便宜的方法，即固相合成肽鏈，然后直接分析，但缺少上述靈活性。合成的產物不能直接進行分析，支持物必須經過洗脫以去掉抗體和有關試劑以便再次檢測。雖然這樣做產物仍然可以檢測數次，如果要進行多次檢測，則不適用。
此外，一套系列肽的消耗應當根據整個實驗的消耗來計算。雖然購買肽只花6000美元就能合成覆蓋400氨基酸的功能區。這些消費并沒有包括人力開支和為眾多實驗提供關鍵信息的開支。如果同數個實驗室同時共用一套肽系列，將能大大減小實驗的開銷。有關生物素標記肽的檢測方法將在下一節闡述。肽鏈系列與固體支持物結合的方法，同有關的基本操作原則一樣，而且一般商品化的產物將會有附帶的操作方法。
肽的合成過程非常適合*自動控制操作，現在已經有用于肽檢測的芯片產品。這樣的檢測將大大提高肽掃描檢測速度和降低成本。經營肽合成的公司應該開發針對某些常用的關鍵蛋白質抗原低成本的肽掃描試劑盒。
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