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氣相色譜儀以氣體作流動相(載氣)，當樣品進入汽化室汽化后，被載氣帶入色譜柱內，樣品中各組份在流動相和固定相之間進行反復多次的分配，由于樣品中各組份的性質不同，在色譜柱中兩相間的分配系數和吸附系數不同，在載氣帶動下各組份在柱子中的運行速度也不同，經過一定的柱長后，各組份在柱子末端分離開，然后用接在柱子后的檢測器根據組份的物理化學性質將組份按順序檢測出來。
氣相色譜儀對氣體純度有較高的要求，所用氣體的純度要達到或略高于儀器自身對氣體純度的要求；若使用不符合要求的低純度氣體，會造成一系列不良影響；一般情況下，氣體純度選擇應掌握以下原則，即微量分析比常量分析要求高，毛細管柱分析比填充柱分析要求高，程序升溫分析比恒溫分析要求高，濃度型檢測器比質量型檢測器要求高，配有甲烷裝置的FID比單FID要求高，中儀器比低檔儀器要求高。氣體純度的要求根據每一家用戶具體使用的哪一類（高、中、低檔）儀器，選擇什么樣純度的氣體，確實是一個比較復雜的問題。
原則上講，選擇氣體純度時，主要取決于：①分析對象；②色譜柱中填充物；③檢測器。我們建議在滿足分析要求的前提下，盡可能選用純度較高的氣體。這樣不但會提高（保持）儀器的高靈敏度，而且會延長色譜柱、色譜儀（氣路控制部件、氣體過濾器）的壽命。
實踐證明，作為中儀器，長期使用較低純度的氣體氣源，一旦要求分析低濃度、高精度要求的樣品時，要想恢復儀器的高靈敏度是十分困難的。而對于低檔儀器，作常量或半微量分析，選用高純度的氣體，會增加運行成本，有時還增加了氣路的復雜性，因此選用氣體的純度要求達到或略高于儀器自身對氣體純度的要求即可，這樣既可以達到工作要求，又能延長儀器的壽命，還不至于增加儀器的運行成本。
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