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分析ATCC菌種生物學特性和病毒學特征

來源:上海一研生物科技有限公司   2017年12月28日 13:45  

自然界中ATCC菌種種類繁多,其裂菌功能在針對細菌耐藥方面具有潛在應用價值。不同噬菌體也呈現出顯著的基因多樣性及宿主特異性。從上海某豬場仔豬腸內容物樣品中分離、純化大腸桿菌的裂解性噬菌體,分析其生物學特性和病毒學特征,為探索應用噬菌體治療細菌性感染提供研究材料。

【方法】 采用雙層瓊脂平板法分離、純化噬菌體,觀察噬菌斑特征,通過電鏡觀察噬菌體形態特征,測定其裂菌譜、*感染復數、一步生長曲線和生物學特性,進行噬菌體全基因組測序和遺傳進化分析。

【結果】 分離、純化獲得一株能裂解大腸桿菌K-12菌株的噬菌體,命名為vB_EcoS_SH2 (SH2),噬菌斑呈圓形、大而透明、邊緣整齊。電鏡觀察SH2的頭部呈二十面體立體對稱,尾部較長。噬菌體的潛伏期為10 min,暴發期為60 min,裂解量高達121 PFU/感染細胞,其*感染復數為0.1。基因組測序和比對結果表明,SH2的核酸類型為dsDNA,基因組全長為49 088 bp,G+C%含量為45%,GenBank登錄號為KY985004,結合電鏡觀察及BLASTp分析,確定其屬于有尾噬菌體目長尾噬菌體科成員。同源性及進化分析表明,該噬菌體為大腸桿菌T1樣噬菌體的新成員。

【結論】 分離鑒定了一株裂解效率*的大腸桿菌T1樣噬菌體,并確認其為T1樣噬菌體新成員,為研究大腸桿菌噬菌體及其抗菌應用提供了新的實驗材料。

噬菌體是一種細菌病毒,在自然界中廣泛存在。噬菌體以細菌為宿主,影響著細菌的生態及進化。大多數噬菌體為有尾噬菌體,具有尾絲蛋白,能特異性識別并結合宿主菌表面的受體。有尾噬菌體目擁有3個成員,分別是肌尾噬菌體科(Myoviridae)、長尾噬菌體科(Siphoviridae)和短尾噬菌體科(Podoviridae)。比較基因組學和蛋白組學分析技術在揭示噬菌體多樣性及其進化關系,以及噬菌體與宿主菌相互作用關系中發揮了重要作用。特別是對噬菌體及其裂菌機制的研究,對減少抗生素的使用和細菌耐藥性的產生具有積極作用。近年來,有較多裂解性噬菌體用于細菌性疾病的預防和治療、細菌檢測及生食蔬菜的表面殺菌劑,為開發噬菌體裂菌制劑展示了廣闊的應用前景。

ATCC菌種一般具有種屬特異性甚至菌株特異性,噬菌體尾絲蛋白與細菌表面受體結合,介導噬菌體侵入細菌,從而發揮裂菌作用,因此,尾絲蛋白和細菌表面受體決定了噬菌體的裂菌譜。本研究分離到一株裂解能力強大的噬菌體,其對大腸桿菌K-12菌株具有裂解效果,通過對其編碼蛋白的比對分析,推測該噬菌體為T1樣噬菌體。通過對其生物學特性及基因序列分析,將為進一步揭示其裂菌機制及后續噬菌體的改造和應用奠定基礎。
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lv丹(工業級混合物) 標準品    750ug/L于異辛烷,1ml    禾草敵 標準品    CDGG-031005-02    1000mg/L于甲醇,1ml,
ATCC菌種

 

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