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核酸保存純化:Streck 采血管和QIAamp核酸純化試劑盒

來源:紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司   2018年01月26日 17:34  

對孕婦外周血中游離 DNA 進行高通量測序(Next Generation Sequencing, NGS),并分析孕婦外周血中攜帶的胎兒的染色體突變異常風險,特別是染色體非整倍體變異的檢測,是近幾年出現的無創產前篩查(NIPT)新技術

 

NIPT產品

基于孕婦游離DNA的胎兒染色體非整倍體檢測(高通量測序法)流程及產品

血液標本采集、運輸、保存

血漿游離DNA提取純化

血漿游離DNA基因文庫構建

文庫產物純化

基因測序

 

血液標本采集、運輸、保存

Streck Cell-Free DNA BCT® 血漿游離DNA采血管

產品英文名稱:Streck Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE

產品中文名稱:Streck BCT® 血漿游離DNA采血管

貨號:218962,230253

 

Streck 血漿游離DNA采血管是一種直接提取的全血收集管,用于收集、運輸和儲存血液樣本。Streck 血漿游離DNA采血管內含防腐劑,它能穩定有核血細胞,防止細胞基因組DNA的釋放,保護血漿游離循環DNA:cfDNA ctDNA和循環腫瘤細胞(CTC)。

230253是218962的升級版,是Streck公司新推將玻璃和塑料的*性能融合在一起的Fusion2TM混合塑料管

 

成份

Streck 218962包含抗凝K3EDTA和細胞液體防腐劑

 

材質

Streck 218962管材是玻璃,Streck 230253管材是一種特制的混合塑料Fusion2,兼具玻璃的*優點和塑料的安全性。

         

品牌

貨號

產品描述

包裝

Streck

218962

Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE

Cell-Free DNA BCT®血漿游離DNA采血管

100管/盒

Streck

230253

Cell-Free DNA BCT® BLOOD COLLECTION TUBE

Cell-Free DNA BCT®血漿游離DNA采血管(混合塑料)

100管/盒

 

 

血漿游離DNA提取純化

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit 循環核酸純化試劑盒

貨號: 55114 品牌:Qiagen

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit (50)

For 50 preps: QIAamp Mini Columns, Tube Extenders (20 ml), QIAGEN Proteinase K, Carrier RNA, Buffers, VacConnectors, and Collection Tubes (1.5 ml and 2 ml)

樣品處理量:5mL

洗脫體積:20-150μL

可以洗去PCR抑制物,如:二價陽離子和蛋白

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑

從人類血漿或血清中濃縮和純化游離DNA和RNA

 

濃縮的核酸,高上樣量,低洗脫體積

回收DNA和RNA碎片

無需有機提取或乙醇沉淀

*去除污染物和抑制劑

 

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒大大簡化了從血漿或血清中濃縮和純化游離DNA和RNA的過程。

 

性能

分析血液中腫瘤特異性的胞外DNA片段和mRNA可對普通血液樣品進行特異性地腫瘤類型檢測。這些存在于血清或血漿中的游離核酸通常都是<1000 bp(DNA)或<1000 nt(RNA)的片段。此外,小至21 nt的miRNAs可作為某些癌癥和疾病狀態的生物標記。

 

經純化和濃縮的游離DNA和RNA不含蛋白、核酸酶和其他雜質,可即用于各種下游應用,包括:

PCR 和定量real-time PCR以及RT-PCR

用于基于血液樣品的癌癥生物標記的研究、驗證和檢測

病毒核酸檢測

 

原理

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒簡化了從血漿或血清中純化游離DNA和RNA的過程。核酸特異性結合到QIAamp Mini離心柱上,污染物流走。PCR抑制物,如:二價陽離子和蛋白,可通過三步有效的洗滌步驟被*去除,結合在離心柱上的純核酸可用水或試劑盒中的緩沖液洗脫。使用QIAamp Circulating Nucleic Acid技術從人類血漿、血清或尿液中獲得游離的DNA和RNA。

 

應用

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒可從含低濃度DNA和RNA碎片的原始樣本(人血漿中常規游離DNA的濃度為1–100 ng/ml)中純化和濃縮游離的DNA、RNA、miRNA,包括病毒核酸。起始樣本體積至多5 ml。

 

適用樣本

QIAamp Circulating Nucleic Acid Kit核酸純化試劑盒可從以下樣本類型中純化和濃縮核酸:

人類血漿

血清

尿液

 

NIPT介紹

NIPT發展

NIPT發展迅速,而且它還不是標準醫療項目,只是一個選擇項目。

NIPT發展快速得異常,消費者在推進。可能原因:同步社交媒體發展,討論較多。

NIPT應用

NIPT在實際運用中要解決的問題:

市場壓力

專業指南的快速變化。高風險孕婦和一般孕婦做咨詢用的時間都不一樣。那么獲得的信息也不同。孕婦查出有問題不一定要終止妊娠,還可以多做應對準備。而且做繼續懷孕決定的比例達到了40%。

NIPS在產前檢測中的準確定位。一開始定位是高危產婦,之后不是高危產婦也對NIPT有興趣。中等風險妊娠群體的NIPT檢測,還會再上升。

NIPT的檢測

NIPT的檢測還不是準確。

低風險用戶越多,PPV值越低。

生物學原因導致的母體的miccroduplications也會影響檢測結果。

NIPT和標準產前檢測項目的比較

標準產前檢測項目:血清生化檢測和nuchal translucency超聲波檢查。

NIPT在在某些檢測方面的錯誤率格外低,比如cfDNA陽性預測方面比標準項目做得好。

NIPT的可選項目:性染色體

常規染色體非整倍體異常項目:21- 三 體 綜 合 征(trisomy 21,T21)、18-三體綜合征(trisomy 18,T18)和 13-三體綜合征(trisomy 13,T13)。

檢測可選項目:性染色體等。NIPT能比超聲波更早知道是否有性別染色體異常。

NIPT技術

美國NIPS的四個公司:4種技術。檢測錯誤率差別較大。

Illumina:WGS 全基因組測序

Sequenom:WGS 全基因組測序

Ariosa Diagnostics:targeted approach on a microarray 微陣列靶向方法

Natera:targeted sequencing for SNP 靶向測序檢測單基因

 

參考文獻

1.染色體非整倍體無創產前檢測技術質控要點及臨床應用進展.曲守方; 于婷; 孫楠; 李麗莉; 陳芳; 吳英松; 黃杰.分子診斷與治療雜志.

2.Cell-free DNA screening blooms in expansion to low-risk pregnancies,Anne Paxton,2017 Issues, ARTICLES, March 2017.

 

Streck 218962(現貨),230253 Cell-Free DNA BCT采血管及更多無創產前檢測產品歡迎您咨詢華雅再生醫學旗艦公司:紅榮微再(上海)生物工程技術有限公司 紅榮微再以“傳遞科學價值,服務科學研究”為宗旨主營干細胞、醫療、細胞治療、器官再生四大板塊的產品

 

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