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用過離子色譜的朋友都知道，離子色譜所用的淋洗液（液相色譜叫流動相）一般都是酸性或堿性溶液，是具有腐蝕性甚至強腐蝕性的，所以液路里像液相色譜里的不銹鋼等金屬部件用的就不多了。離子色譜液路中的接頭、密封件（卡環、密封墊等）絕大多數都是由聚四氟、增強四氟、橡膠、PEEK材料制成的。
先從吸液部分說起。
1、液相用的吸濾頭大多都是不銹鋼粉末壓制而成的，離子色譜用的是一些塑料材料如聚四氟、PEEK等粉末通過某種方式加工而成的。
2、吸液管路一般都是透明的聚四氟管，由于是吸液管，阻力還是小一點的好，這個管路一般要短一些，內徑大一些，長度一般都在1.0-1.5m，管外徑一般都是3.2mm，內徑一般都是2.0mm，這個和液相色譜一樣。
3、單向閥閥球、閥座和液相色譜一樣，都是人造寶石或陶瓷材料。閥體和閥座（也有人叫單向閥接頭）液相色譜大多都是不銹鋼材料，離子色譜大多都是PEEK材料。
4、泵頭也是一樣，液相色譜一般都是不銹鋼材料，離子色譜一般都是PEEK材料。也有的為了增加外觀的美觀程度或增加耐壓強度，而把液路用的PEEK材料鑲嵌到了不銹鋼件內。
5、柱塞桿和液相用的一樣，人造寶石或陶瓷的，高壓密封圈和液相色譜有些區別。端面密封為PEEK、聚四氟、增強四氟等材料件，這個和液相一樣。
6、中心孔液相有的是不銹鋼材料件，離子色譜用的一般是更能耐腐蝕的純鈦材料件。
7、柱后清洗由于不在系統液路內，不涉及強腐蝕液體（既使是有部分淋洗液滲透出來，也會被 的清洗液稀釋掉），不用承受高壓，所以液路部件及管路、接頭等件用什么材料也就無所謂了，一般也就和液相色譜的一樣了。
8、阻尼器、進樣閥液路系統也都是PEEK、聚四氟等材料部件。
下面就說說色譜系統的核心部件色譜柱吧。陰離子系統色譜柱柱管和接頭等件大多都是不銹鋼的，填料大多都是陰離子樹脂的。陽離子系統色譜柱柱管大多都是PEEK或鋼化玻璃的，填料為陰離子樹脂。
抑制器是離子色譜的又一核心部件，它一般都采用膜結構和柱結構。膜結構的一般由PEEK等塑料部件、樹脂填料、樹脂膜組成，也有的會用到些純鈦等部件。柱結構，柱管及接頭等大多都是PEEK等耐腐蝕材料，填料大多都是抑制樹脂或抑制膠等。
下面就剩檢測池了。離子色譜的檢測池以PEEK、聚四氟等塑料材料為主，像電導檢測器電極可能會采用耐腐蝕較強的316不銹鋼，鍍銀部件，鍍鉑部件等導電材料。
至于廢液管，一般都是內徑較細，一般為0.25mm、0.5mm或0.75mm,較長的聚四氟管了,一般為1.5-2.0m。
液路中的高壓管路和連接抑制器、檢測池的管路，那就不用說了，都是PEEK管。為了降低背壓的，管路內徑可以適當粗一點，比如0.5mm、0.75mm，為了減小死體積的內徑適當細一點，比如0.25mm、0.18mm、0.13mm等。外徑絕大多數都是1.6mm的。
離子色譜的液路系統大致就是這樣。主要是采用耐腐蝕的材料部件，當然有些也得能耐一定得壓力。
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