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色譜分離常見問題是峰形、分離狀況、洗脫時間或性能改變。可以分兩個步驟來處理不可接受的色譜分離。首先，從色譜方面來評價存在的問題，其次，對產生問題的原因進行獨立分析。評價色譜分離時建議使用標準品而不是樣品。每次進樣時應該做好樣品的特性和色譜性能記錄，這樣需要作比較時能夠提供歷史數據。
下面為大家帶來導致色譜分離改變的常見原因及應采取的解決方法：
下面為大家帶來導致色譜分離改變的常見原因及應采取的解決方法：
1.系統不平衡
使色譜柱和檢測器有足夠的平衡時間。如果進行梯度分析，兩次分析之間，平衡時間要充足。
次使用離子對試劑，要保證用充足的時間和充足的流動相沖洗色譜柱，以達到充分平衡。
2.梯度分析時未經充分平衡
在兩次梯度分析間應有足夠的平衡時間。進樣要保證是初始時間的流動相組分流經色譜柱。未經充分平衡時會導致錯誤的保留時間。
3.泵壓力/運行故障
參考流量曲線圖，找出原因并糾正。
4.室溫變化
保證儀器周圍溫度穩定并達到平衡。如果無法達到溫度穩定，或者不能達到平衡，建議使用色譜柱溫箱，柱溫箱系統應*將色譜柱封閉。確保預先混合的溶劑能互溶，且流動相已經混合均勻。
5.進樣體積太大、濃度太高
減小進樣體積或稀釋原始樣品（注：使用弱溶劑，進樣體積可增至約為柱體積的10%，使用強溶劑進樣體積能達到柱體積的1%）。
6.色譜柱被污染
用一根性能已知的色譜柱換下被污染的色譜柱，并進行一系列標準樣品分析，比較保留時間，如果保留時間重復，表明原色譜柱已被污染。清洗色譜柱或更換新色譜柱。
快速指南：1.引起保留時間變化的常見原因是系統不平衡，開始分析前，系統必須平衡好。2.分析過程中溫度改變是保留時間變化的另一主要原因。3. 建議在等度分離中盡量預先混合好流動相。
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