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凡事有利必有弊，只不過有時利大于弊時，讓人們很難發現他的弊而已，世界萬物，沒有十全十美的。旋轉蒸發器也是，它的存在不僅僅只有優點，缺點也有：
一、優點
1、所有的旋轉蒸發器都內置了一個升降馬達，該裝置可以在斷電的時候自動將燒瓶提升到加熱鍋以上的位置。
2、由于液體樣品和蒸發瓶間的向心力和摩擦力的作用，液體樣品在蒸發瓶內表面形成一層液體薄膜，受熱面積大；
3、樣品的旋轉所產生的作用力有效抑制樣品的沸騰。綜上特征以及其便利的特點，使現代化的旋轉蒸發器可用于快速、溫和地對絕大多數樣品進行蒸餾，即使是沒有操作經驗的操作者也能完成。
二、缺點
對于旋轉蒸發器使用時存在的弊端，也是不可忽視的。比如說有些樣品在加熱的過程中，會出現沸騰的狀況，例如加熱的乙醇和水，一旦發生沸騰的狀況，就會造成收集到的樣品流失。對于比較難做蒸餾處理樣品，可以在旋轉蒸發器上配置一個特殊的裝置，就是冷凝管，可以有效的抑制沸騰狀況的發生。
你還有注意：旋轉蒸發器器上的磁力攪拌器內部的器件受熱都有上限，因此在加熱的時候一定要考慮到，保證不讓機器只加熱，切記把電機的狀態改成旋轉的狀態，這樣能夠較大程度的保護好磁力攪拌器。同時，為了保證旋轉蒸發器不被損害，通常儀器內部會放有絕緣材料，因此我們次使用旋轉蒸發器上的磁力攪拌器的時候會發現冒出少許白煙或有刺鼻的味道，這些都屬于正常現象，不是產品質量問題，只要保持通風就可以了。
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