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二手島津氣相色譜儀因濕度增加而發生故障，通常會因局部發熱而排除。例如，氣相色譜儀在40°C的溫度下無法正常工作，并且在溫度降低后可以正常工作。可以將氣相色譜儀恢復到常溫，并使用電吹風機或電烙鐵來部分吸收水池以找出故障。這稱為氣相色譜儀局部加熱。
在長時間使用氣相色譜儀之后，分割線的內徑逐漸變小或甚至*阻塞。分割線堵塞后，氣相色譜儀入口出現異常壓力，峰形惡化，分析結果異常。在大修過程中，無論是否可以確定分割線是否被阻擋，都需要清潔分割線。氣相色譜儀分割線的清潔通常選擇有機溶劑，例如丙酮、甲苯。通過簡單的清潔很難清潔嚴重堵塞的分割線，并且需要一些其他輔助機械方法。通過選擇合適的鋼絲厚度可以簡單地解除分流線，然后用有機溶劑如丙酮、甲苯洗滌。由于不容易預先準確地判斷轉向部分的狀態，因此在大修過程中手動分離的二手島津氣相色譜儀必須清潔分流管線。
氣路泄漏會使二手島津氣相色譜儀無法正常工作、保留時間不穩定、色譜響應變化等氣體泄漏主要表現在以下兩個方面：
1、氣相色譜儀載氣流量異常。如果流速太小，則流速太小，流速不穩定。
2、輔助空氣泄漏，如氣相色譜儀FID，FID點的性能不著火、恒溫炒作是基線不規則運動。
當氣相色譜儀工作不正常，或者色譜圖上的現象懷疑泄漏時，應找到并保持泄漏點。
二手島津氣相色譜儀對分析室的要求
（1）氣相色譜儀分析室周圍不得有強磁場，易燃或強腐蝕性氣體。
（2）室內環境溫度應在5至35度范圍內，濕度應小于或等于80％（相對濕度），并應在室內保持空氣流通。有條件的工廠安裝空調。
（3）準備一個能承受整個氣相色譜儀，寬度適中，操作簡便的工作平臺。一般工廠用水泥平臺（0.6~0.8米高）較好，平臺不能靠近墻壁，距離墻面0.8~1.0 m，便于布線和維護。
（4）二手島津氣相色譜儀的電力線容量應在3KVA以上，氣相色譜儀的電源不應與大功率耗電設備或頻繁變化的電力設備共用。電源必須良好接地。通常，將長度約為0.5~1.0 m的銅棒（線）釘在濕地（或鹽溶液）上，然后將氣相色譜儀電源接地點與其連接。通常，接地電阻小于1歐姆。
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