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1、在有平臺的潔凈室內編制培養皿 (XX 潔凈室, XX 測點), 操作前應用浸濕 75%乙醇的醫用脫脂棉花擦拭平臺。測試人員雙手用同樣方法嚴格消毒。在編制過程中再次仔細檢查培養基平皿的質量, 有變質、破損或污染不能使用；
2、用浸濕 75%乙醇的醫用脫脂棉花擦拭采樣器的采樣口, 采樣管、采樣器的項蓋, 轉盤及罩子內外表面；
3、采樣器經消毒后不放入培養皿, 啟動儀器空轉運行不少于5 min, 使儀器中的殘余消毒劑蒸發；
4、根據手術室的潔凈度設定采樣量，采樣器的流量(L/min)X 采樣時間(min)=采樣量(L)；
5、放入培養皿,蓋上蓋子后調節采樣器縫隙高度。采樣操作時, 培養皿應輕拿輕放, 用“五指抓拿”培養皿外徑, 盡量避免人為對樣本造成污染；6、采樣點的布置及采樣點數量。
浮游菌采樣器一般是根據等速采樣理論設計,采樣直接,采集頭口風速與潔凈室內風速基本一致,能更地反映潔凈室內的微生物濃度。采樣器由上下兩部分組成，上部為采樣頭、培養皿座、采樣泵、采樣泵座、采樣泵電源。下部為控制板、存儲器、LCD顯示器、鍵盤、電池組件。
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