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造成液相色譜儀流動相供給不暢的原因可能是：流動相已經接近用完了，管路中吸入氣體引起泵壓力不穩定。
應經常觀察貯液器中流動相的量，加足流動相保證所有樣品分析完畢。輸液管路上安裝沉子至瓶底，貯液器蓋上留一小孔正好夾住進液器，使其不能上下移動。
過濾器阻塞會引起管道和泵腔真空變化，使壓力不穩。當過濾器被微粒所阻塞或長霉時，去掉過濾器后系統會運轉正常，換上新的過濾器即可，有時候換上新過濾器任然不暢，那么就需要檢查流動相的制備過程，或者換上大孔徑的過濾器。不管如何，流動相都要重新過濾。
流速過高、阻力大，造成真空化現象，這是由于過濾器孔徑、管道內徑、流速和溶劑粘度等引起的。如果流速大于10mL/min，常會出現這種現象，試著用下列方法解決。
如何解決液相色譜儀流動相供給不暢的問題：
1試用低流速，若問題解決了則再進行下一步；
2換大孔徑的過濾器；
3增加進液管內徑；
4抬高或加壓貯液器；
5改低流速；
6不用入口過濾器（但流動相一定要先過濾）。
當貯液器蓋子太緊，在貯液器內形成真空，打出的流動相不連續。應松開蓋子或留有1mm縫隙。
進液管路阻塞或彎曲折疊會使泵抽不到液，注意調整進液路道或更新。
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