蛋白質(zhì)的折疊速率

蛋白質(zhì)的折疊是指一個蛋白質(zhì)從它的變性狀態(tài)轉(zhuǎn)變到它的特定生物學(xué)天然構(gòu)象的過程。現(xiàn)在人們已經(jīng)普遍接受了共翻譯折疊的理論，認(rèn)為mRNA在核糖體上翻譯的過程，蛋白質(zhì)折疊就開始了，這一過程遵循自由能減少規(guī)律，即蛋白質(zhì)在一定時間內(nèi)沿著某一或某些特定的路徑（過渡態(tài)系統(tǒng)）達(dá)到其自由能小（極小）的天然構(gòu)象。各種光譜技術(shù)，質(zhì)譜和核磁共振等試驗(yàn)方法都可用來研究蛋白質(zhì)的折疊，為研究蛋白質(zhì)折疊速率預(yù)測累積了許多試驗(yàn)數(shù)據(jù)。為了理解蛋白質(zhì)的折疊機(jī)理，其重要任務(wù)之一便是確定蛋白質(zhì)折疊速率的決定因素。許多對小的二態(tài)蛋白質(zhì)的理論研究表明，蛋白質(zhì)的大小 形態(tài)以及結(jié)構(gòu)特征等都對其折疊速率產(chǎn)生影響，但在揭示它們的相互關(guān)系過程中受到種種限制。經(jīng)過多年的努力，到現(xiàn)在已經(jīng)產(chǎn)生了許多較好的方法，能夠比較地預(yù)測出一些小型蛋白質(zhì)的折疊速率。有的蛋白質(zhì)折疊需要幾毫秒，而有的蛋白質(zhì)折疊需要幾個小時，所以不同蛋白質(zhì)的折疊速率（蛋白質(zhì)折疊所用時間的倒數(shù)）差別很大，為了便于不同蛋白質(zhì)折疊速率的比較，人們常用In來表示蛋白質(zhì)的折疊速率。蛋白質(zhì)折疊速率的預(yù)測方法大致分為基于蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法，基于蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法和基于蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)的預(yù)測方法。