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蛋白質組指的是一種基因組所表達的全套蛋白質，即包括一種細胞乃至一種生物所表達的全部蛋白質。蛋白質組學本質上指的是在大規模水平上研究蛋白質的特征，包括蛋白質的表達水平，翻譯后的修飾，蛋白與蛋白相互作用等，由此獲得蛋白質水平上的關于疾病發生，細胞代謝等過程的整體而全面的認識。
蛋白質組學是以蛋白質組為研究對象，研究細胞、組織或生物體蛋白質組成及其變化規律的科學。蛋白組學分析儀包括高通量蛋白質穩定性分析儀、高通量超微量全光譜分析儀、4SPR生物分子相互作用儀、非標記生物分子分析儀，主要就是進行蛋白質組學的高科技儀器。
隨著人類基因組計劃的實施和推進，生命科學研究已進入了后基因組時代。在這個時代，生命科學的主要研究對象是功能基因組學，包括結構基因組研究和蛋白質組研究等。盡管現在已有多個物種的基因組被測序，但在這些基因組中通常有一半以上基因的功能是未知的。因此在上世紀90年代中期，上產生了一門新興學科－蛋白質組學，它是以細胞內全部蛋白質的存在及其活動方式為研究對象。可以說蛋白質組研究的開展不僅是生命科學研究進入后基因組時代的里程碑，也是后基因組時代生命科學研究的核心內容之一。這也是蛋白組學分析儀發展的重要意義。
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