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倒置熒光顯微鏡，是指與一般顯微鏡相比，其物鏡、聚光鏡和光源的位置都顛倒過來，由熒光附件與顯微鏡有機結合構成的顯微鏡。
倒置熒光顯微鏡成像原理介紹：
激發光從物鏡向下落射到標本表面，被反射到物鏡中并聚集在樣品上，樣品所產生的熒光以及由物鏡透鏡表面、蓋玻片表面反射的激發光同時進入物鏡，經雙色束分離器使激發光和熒光分開而成像。物鏡和聚光鏡的工作距離很長，能直接對培養皿中的被檢物體進行顯微觀察和研究。適用于土壤微生物培養實驗，具有在培養瓶或培養皿內進行顯微觀察的特點，可以觀察不經染色的透明活體。特別適用于對活體細胞和細胞離體培養等顯微觀察。
倒置熒光顯微鏡功能特點:
(1)提供足夠能量的能激發出熒光的光源。
(2)有著適應不同物質所需的激發光譜一組濾色片，從光源中選擇合適的激發光譜，使析出的光譜與該物質的吸收光譜重合，以期望獲得大的熒光。
(3)為獲得較弱的熒光圖像，還要建立一套截止濾色片，它使所需觀察的熒光進入系統成像，而將其余的光波，包括發射光阻擋在外，用來提高圖像的襯度。
(4)放大的光學系統應適應熒光的特性，終獲得既能觀察又能攝影的高亮度、高分辨力的良好襯度 的熒光圖像。
(5)照明方式通常為落射式，即光源通過物鏡投射于樣品上。
(6)光源為紫外光，波長較短，分辨力高于普通顯微鏡。
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