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操作氣相色譜儀如何選用不同氣體純度的氣源做載氣和輔助氣體，雖然是一個老的技術問題，但是對于剛剛接觸氣相色譜儀的用戶，目前很難找到有關這方面的綜合資料，所以他們總是到處詢問究竟選擇什么樣的氣體純度的這類問題。根據每一家用戶具體使用的那一類(高，中，抵擋)儀器，選擇什么樣純度的氣體，確實是一個比較復雜的問題。
原則上講，選擇氣體純度時，主要取決于①分析對象;②色譜柱中填充物;③檢測器。
我們建議在滿足分析要求的前提下，盡可能選用純度較高的氣體。這樣不但會提高(保持)儀器的高靈敏度，而且會延長色譜柱，整臺儀器(氣路控制部件，氣體過濾器)的壽命。實踐證明，作為中高檔儀器，長期使用較低純度的氣體氣源，一旦要求分析低濃度的樣品時，要想恢復儀器的高靈敏度有時十分困難。對于低檔儀器，作常量或半微量分析，選用高純氣體，不但增加了運行成本，有時還增加了氣路的復雜性，容易出現漏氣或其他的問題而影響儀器的正常操作。
我們在使用氣相色譜儀的時候，一般都是使用氫焰氣相色譜儀三氣的流量比，有關資料均建議為：氮氣：氫氣：空氣=l：l：10，但由于轉子流量計指示流量的不準確性，事實上誰會去苛求這個配比呢?本人認為各氣旌以良好匹配，目的是既有高的檢測器靈敏度又能有較好的分離效果同，還不致于容易熄火。本著上述原則氣比應按下法調節：
氮氣流量的調節
在色譜柱條件確定后、樣品組分分離效果的好壞、氮氣的流量大小是決定因素，調節氮氣流量時。要進樣觀察組分分離情況，直至氮氣流量盡可能大且樣品組分有較好分離為止。
氫氣和空氣流量的調節
氫氣和空氣流量的調節效果，可以用基流的大小來檢驗，先調節氫氣流量，使之約等于氮氣的流量。再調節空氣流量，在調節空氣流量時，要觀察基流的改變情況，只要基流在增加，仍應相向調節，直至基流不再增加不止，后，再將氫氣流量上調少許。
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