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合理安裝、正確操作設備是保證玻璃反應釜運行穩定的前提。
一、注意保溫。由于玻璃反應釜外套厚度較薄，因此保溫性能較差。在使用高溫、低溫的過程中，用戶均需要使用保溫材料對釜體進行保溫保護。也可選擇帶真空保溫層的三層玻璃反應釜，這種結構適合作超低溫反應。同時，用戶需對反應釜的釜體以及導熱介質循環的管子用保溫材料包裹，注意保溫層的厚度，以保證具有較好的保溫效果。
二、控溫介質選擇。一般而言，用戶會根據所需要的反應溫度。選擇不用性質的控溫介質，作為反應的熱量傳播介質。低溫選擇冰乙醇，常溫選擇水，高溫則選擇二甲基硅油。使用低溫或者高溫時，注意選擇合適的介質，關鍵在于粘度。粘度太大介質，循環泵可能帶不動，介質循環效果不好，無法達到需要的控溫效果。貿然更換大功率的循環泵，壓入介質壓力過大，易損壞玻璃反應釜內襯，反應釜破裂。通常廠家都會根據自己的產品，配套相應的導熱介質及加熱制冷設備供選擇。三晶玻璃儀器配的是二甲基硅油。
三、存放位置需合理。玻璃反應釜作為反應放大試驗裝置，體積通常為50-200L，特定情況體積可以定制。由于釜體為玻璃材質，不銹鋼為支架且架腳為腳輪，故存放位置需要慎重選擇。腳輪雖然可以有腳扣固定，但是穩定性不強。因此，用戶在存放過程中注意選擇平坦的地方放置，并且保持機械攪拌中心與反應釜一致，否則易搖晃不穩，發生安全事故。另外，必須放置在通風位置好的場所。
四、加料注意事項。由于反應釜為獨立的反應架子，且預留加料口較小，因此加料過程比較困難。固體類試劑可以配成溶液加入釜內，液體類試劑可通過配套水泵或者油泵抽入釜內。尤其是，通過恒壓滴液漏斗或常用滴液漏斗將反應料加入反應釜中，需要配套相應的移動梯子，以便工作人員加入試驗物料。玻璃反應釜一次性投料量不宜過大，用戶需要根據反應的溫度、回流以及壓力，進行評估，加入適宜的用料量，一般不宜超過釜體的2/3。
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