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干貨分享|熱啟動酶耐熱機制全面解析

來源:翌圣生物科技(上海)股份有限公司   2020年05月08日 09:35  

干貨分享|熱啟動酶耐熱機制全面解析

 

常規(guī)PCR技術因能夠快速擴增任何已知的DNA///片段而被廣泛應用于分子生物學的各個領域。但常規(guī)型PCR技術容易出現引物二聚體或錯配引起的非特異性擴增等現象,造成實驗結果的不準確性。熱啟動型PCR能夠很好的解決上述問題,是常用的提高PCR特異性的方法。

 

熱啟動酶介紹

熱啟動酶Hot start enzyme主要利用酶的修飾物在常溫下抑制DNA聚合酶的活性,加熱至變性溫度時修飾物失活,釋放酶活,從而使PCR反應得以正常進行。目前市面上常用的DNA聚合酶熱啟動修飾方法主要有化學修飾、配體修飾抗體修飾等,不同的熱啟動修飾方法原理上有所區(qū)別,各有優(yōu)劣勢。

 

化學法

DNA聚合酶的化學法修飾,一般采用化學小分子如酸酐等有機物與聚合酶上的側鏈氨基酸賴氨酸通過化學反應相互作用,使酶低溫時失去酶活,溫度升高后,酸酐與氨基之間的化學鍵斷裂,酶活釋放,從而達到熱啟動效果。化學修飾可有效封閉酶的活性,操作簡單,但酶活性釋放速度較慢,依賴溫度激活DNA聚合酶,能有效抑制非特異性產物,可在室溫下配置反應體系且對PCR反應buffer要求較高。

 

 

圖1:化學法修飾熱啟動酶原理圖

 

配體法

配體法修飾,主要借助核酸適配體封閉酶活。顧名思義,核酸適配體一般指一類具有特異性識別功能的單鏈核酸分子,可以是RNA也可以是DNA,長度一般為25~60個核苷酸。作為一種寡核甘酸序列的識別分子,作用的靶分子范圍廣泛,從無機金屬的小分子到生物領域的大分子。這些適配子可以形成特定的空間構象,從而在表觀功能上與抗體類似。對蛋白質或其他小分子物質具有高度特異性、親和力。核酸適配體通過非共價鍵與DNA聚合酶結合,進而抑制聚合酶在非許可溫度下的聚合反應。一般核酸適配體的篩選所需周期較短,整個過程能夠依賴自動化,簡便快捷。

 

2:配體法修飾熱啟動酶原理圖

 

 

抗體法

抗體法熱啟動酶一般考慮使用DNA聚合酶抗體封閉酶活性,使其在低溫時處于無活性狀態(tài),在加熱至變性溫度時抗體變性,解除封閉從而釋放活性,可以大大避免錯配或引物二聚體引起的非特異性擴增。另一方面針對低豐度基因,封閉抗體在避免預變性前的DNA聚合酶和模板的非特異性結合的同時,增加了引物與微量的正確模板碰撞退火的效率,從而保證低豐度基因的有效檢出,大大提升反應靈敏度和擴增效率。

 

3:抗體法修飾熱啟動酶原理圖

 

表1:熱啟動酶常見修飾方法優(yōu)劣勢比較

酶活封閉類型

化學修飾

配體修飾

抗體修飾

原理

化學小分子和DNA聚合酶活性中心結合封閉酶活

核酸適配體通過非共價鍵作用與聚合酶結合封閉酶活

DNA聚合酶抗體與聚合酶結合封閉酶活

酶活釋放條件

溫度:大于95 ℃

時間:10-15 min

溫度:大于60 ℃

時間:1-5 min

溫度:大于70 ℃

時間:30 s-5 min

優(yōu)點

酶活性維持更加穩(wěn)定且無任何外源DNA污染,性價比較高。

不需要激活步驟,穩(wěn)定性高,減少樣品降解的可能性。

酶激活時間短,保證酶活,親和力強,靈敏度高。

缺點

酶激活時間較長可能會影響酶的活性,導致PCR產物的產量降低。

核酸配體是一種可逆抑制劑,不如化學修飾法穩(wěn)定,特異不夠強

抗體修飾是一種動態(tài)平衡,抗體生產成本高試劑配比優(yōu)化時間長

 

以上簡單介紹了熱啟動酶的常見類別和各種熱啟動方法的優(yōu)劣勢,其中化學修飾物不能夠批量合成,而且需要較長的激活時間聚合酶才能釋放酶活。配體修飾DNA聚合酶只在20-25°C效果較好,到40°C時,聚合酶的活性就被釋放出來,特異性不好;而抗體法修飾熱啟動酶對應的封閉效果佳,酶活釋放速度快,從而大大降低PCR反應時間,是目前IVD市場上應用較多的一種熱啟動酶改造方法

 

熱啟動酶應用

熱啟動酶在熱啟動PCR的應用方面較為廣泛不僅有效防止非特異性PCR產物,而且在較難擴增的PCR反應如單拷貝基因的擴增、多重PCR和超長片段的擴增等應用尤為突出,大大改觀了傳統PCR技術的局限性在病原微生物檢測、遺傳病診斷和法醫(yī)鑒定等各個領域等實際應用中頗為廣泛。在應對爆發(fā)的新guan疫情方面,熱啟動酶亦貢獻頗多。目前市面上應用于SARS-Cov-2的一步法RT-qPCR檢測試劑的核心酶基本都是抗體法熱啟動酶

 

 

相關產品

 

類型

名稱

貨號

規(guī)格

價格(元)

優(yōu)惠價(元)

抗體法熱啟動酶

Hieff Unicon® Hotstart J-Taq DNA polymerase

13086ES60/76/90

100 U/500 U/

5000 U

詢價

Hieff Unicon® Hotstart D-Taq DNA Polymerase

10715ES01/03/25/60

100µl/1mL/25mL/

100mL

1652/13252/127852/887652

/

封閉抗體

Hieff® anti-Taq DNA Polymerase Antibody Taq酶單克隆抗體

31301ES60/80/90/92/93/94

100 µg/1/5/10/100/1000 mg

1153/3653/14653/26353/231753/1969552

/

Hieff® anti-exonuclease of Taq Antibody Taq酶5'→3'外切酶單克隆抗體

31302ES60/80/90/92/93/94

100 µg/1/5/10/100/1000 mg

1153/3653/14653/26353/231753/1969552

/

 

參考文獻

【1】Michael R. Green, Joseph Sambrook. Hot Start Polymerase Chain Reaction (PCR)[J]. 2018, 2018(5):pdb.prot095125.

【2】Kermekchiev, M. B . Cold-sensitive mutants of Taq DNA polymerase provide a hot start for PCR[J]. Nucleic Acids Research, 2003, 31(21):6139-6147.

【3】Chou Q , Russell M , Birch D E , et al. Prevention of pre-PCR mis-priming and primer dimerization improves low-copy-number amplifications[J]. Nucleic Acids Research, 1992, 20(7):1717-1723.

【4】劉峰濤,柴立輝,馬遠方.DNA聚合酶適配子6-10提高定量PCR的特異性[J].臨床檢驗雜志,2009,27(03):164-166.

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