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日本理學光譜儀在分析時，分析速度比較快精度及準確性都比較高，促使其應用范圍不斷的變廣。
現如今，在工業生產領域、社會領域、醫學醫藥領域生命科學領域中，X射線熒光光譜儀有著良好的應用。除了這些領域外，其應用逐漸的擴展至食品安全領域、藝術品鑒定領域中，取得了良好的應用效果。隨著X射線熒光光譜儀應用領域的拓寬，促使人們更好的認知世界、認知物質，有利于提升我國整體的科學技術水平，促進社會的發展。
環境科學是與人們的生活息息相關的領域，比如土壤、水體元素分析，電子設備有害物質測定等。有專家為了測定肥料對果實中元素濃度的影響，分別采用傳統的耕作模式和有機肥耕作模式來進行種植和培育，果實成熟后，利用日本理學光譜儀分析果實中的元素濃度，經過檢測之后發現，利用有機肥耕作模式培育出來的榛子、無花果中的部分元素的濃度明顯高于傳統的耕作模式。
工業廢料對環境的污染比較大，包含的種類比較多，比如城市污泥、釀造業污泥、橄欖油廠廢水等，傳統的工業廢料處理方法為掩填埋筑，但在X射線熒光光譜儀研究領域中，改變傳統的處理方法，以重復利用為原則，降低其環境污染，緩解能源資源緊缺現狀。
日本理學光譜儀特點
(1)熒光分析的主要特點是靈敏度高、選擇性好，熒光分析的靈敏度要比吸收光譜測量高2-3個數量級。分光光度法通常在10-7級，而熒光的靈敏度達10-9。
(2)強選擇性強，熒光物質具有兩種特征光譜：激發光譜和吸收光譜，相對于分光光度法單一的吸收光譜來說，熒光光譜可根據激發光譜和發射光譜來鑒定物質。
(3)信息量豐富，能提供熒光物質的多種參數。
(4)但是熒光分析方法也有其不足之處：①很多物質本身不發熒光；②熒光的產生與化合物結構的關系不明確；③干擾因素多，光分解、氧淬滅、易污染。
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