實驗材料
GenoSPYD過濾試劑盒(Blue DNA Compaion公司,法國);
Precellys Evolution組織研磨器(Bertin公司,法國);
MagSPYD自動化核酸提取平臺(Blue DNA Compaion公司,法國);
MIC PCR儀;
GenoSPYD針對Enterococcus spp與E.coli的q-PCR定量試劑盒。
實驗程序
1.微生物樣品收集:每個樣品被0.45μm的濾膜過濾。之后將濾膜裝到GenoSPYD裂解管中,并加入1.5mlGenoSPYD細菌裂解緩沖液;
2.將裂解管放入到Precellys Evolution組織研磨器中,研磨程序為轉速6500rpm、3個循環、每個循環研磨45s、循環間歇30s;
3.RNA提取:包含RNA的溶菌產物使用GenoSPYD RNA提取試劑盒進行純化,可在MagSPYD自動化核酸提取平臺進行;
4.在MIC PCR儀上進行qRT-PCR的檢測。
實驗結果
圖1為對Enterococcus spp檢測的qRT-PCR放大曲線結果, 表1為水中腸球菌Enterococcus spp與大腸桿菌E.coli的LOQ(定量檢測限)和LOD(檢測下限)的結果。
結論
GenoSPYD自動化產品解決方法配合Precellys組織研磨器可以在3小時內快速檢測和定量活微生物樣本中一些特定如大腸桿菌、腸球菌、葡萄球菌、假單胞菌的RNA含量等。此方法的水質檢測指標可以達到100CFU,同時也被世界著名水務公司Suez Environment蘇伊士環境集團認證。
細菌樣本裂解程度直接決定了之后提取RNA的效率,Precellys Evolution研磨儀具備高性能、高效率、安全等特點,同時有冷卻裝置Cryolys Evolution,可使整個研磨過程的溫度準確維持在0-10℃,加配無RNA酶的研磨kit,輕松實現穩態RNA的提取,助力水源中細菌污染物的快速定量檢測,值得信賴!
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