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生物反應模擬器是指利用自然存在的微生物或具有特殊降解能力的微生物接種至液相或固相的反應系統。
目前研究得多的兩種反應器是"升降機型反應器"和"土壤泥漿反應器"。升降機型反應器是通過水相的流動來提供適當的營養、碳源和氧氣，從而達到降解土壤中污染物質的目的。
與固相系統相比，該設備能夠在更短的時間內將污染物進行有效降解。該生物反應器技術已經應用于有機污染土壤的生物修復中。
生物反應模擬器是利用生物體所具有的生物功能，在體外或體內通過生化反應或生物自身的代謝獲得目標產物的裝置系統、細胞、組織器官等等。
該設備是使生物反應得以實現的裝置。生物反應器有各種各樣的形式，要使生物反應器運行得好，必須首先對生物反應器和反應特征有深刻的理解，這就是生物反應器工程的概念。
該設備工程著重研究生物反應器本身的特性，如其結構和操作方式、操作條件對細胞形態、生長、產物形成的關系。它與生物反應工程結合，共同解決各種生物反應的生物反應器、操作條件的選擇問題。
生物反應模擬器聽起來有些陌生，基本原理卻相當簡單。胃就是人體內部加工食物的一個復雜生物反應器。食物在胃里經過各種酶的消化，變成我們能吸收的營養成分。
生物工程上的生物反應器是在體外模擬生物體的功能，設計出來用于生產或檢測各種化學品的反應裝置。或者說，生物反應器是利用酶或生物體(如微生物)所具有的生物功能，在體外進行生化反應的裝置系統，是一種生物功能模擬機，如發酵罐、固定化酶或固定化細胞反應器等。
在固定化酶廣泛應用的基礎上，人們發現天然細胞本身就具有多功能的系列化反應系統采用物理或化學方法將細胞固定化，是利用酶或酶系的一條捷徑。
一個固定化細胞反應器猶如一臺"生命活動功能推動機"。固定化細胞技術開始于70年代，其實際應用程度已超過固定化酶。如美國、歐洲、日本均采用固定化菌體柱床工藝大規模生產高果糖漿。
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