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全自動萃取儀是一套由液體處理平臺衍生開發出的能夠在無人值守情況下自動化運行固相萃取方法的固相萃取儀。包括固相萃取的活化、上樣、清洗、洗脫步驟，以及樣品的切換。現有的技術分為單通道固相萃取儀和多通道固相萃取儀。
全自動萃取儀的特點：一套成熟的自動固相萃取儀應該滿足自動化、模塊化、經濟化、平行化、功能化、擴展化、可靠化這幾個特點。
●自動化：一套完善的自動化固相萃取系統可以真正在無人值守的情況下完成固相萃取方法的應用。有些固相萃取儀僅僅能完成部分固相萃取的步驟，不能成為自動化固相萃取儀。
●模塊化：可以根據不同用戶的應用切換不用的模塊，完成不同固相萃取方法的應用，如雙柱疊加。
●經濟化：一套成熟的全自動固相萃取儀應該給客戶提供經濟化的后期使用體驗。包括試劑、耗材如SPE小柱的選擇。應該可以兼容市售的主流SPE小柱供應商的產品。有些自動化固相萃取儀如賽默飛世爾科技（ThermoFisherScientific）旗下的戴安（Dionex）產品，美國吉爾森(Gilson.inc)，Caliper公司的產品能滿足這個要求。
●平行化：使用自動化固相萃取系統的客戶往往希望能夠平行處理，也就是同時處理多個樣品，這種對平行化的要求可以體現在固相萃取的每個步驟，包括小柱活化、上樣、清洗、洗脫。所謂平行處理也就是同時處理，有些儀器如Dionex公司的Autotrace型號在上樣步驟并不能真正的達到平行處理。但是，在處理大體積樣品時（200mL，甚至500mL以上樣品），在固相萃取四個步驟中，真正耗費時間的是上樣環節，下表以處理一個樣品為例。可以看到實際處理一個樣品時，上樣時間幾乎占到總時間的94%。Dionex的AutoTrace280平衡了萃取效率和儀器成本的綜合因素，提供上樣環節支持多6通道同時運行，其它步驟（活化、清洗、洗脫）單獨運行的設計。
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