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目前在種子檢驗工作中，種子發芽率的測定，常見的方法就是把種子按組分別擺放在發芽床上，標記后送入種子發芽箱中開始發芽試驗，然后對發芽的種子數量及發芽的天數進行統計。這種方式的好處就是測定的效率非常高，試驗的周期可以大大縮短，因此種子發芽箱作為種子發芽率測定中應用的重要儀器設備，在當前的種子檢驗工作中，應用是比較廣泛的。
種子發芽箱具備溫度、濕度、光照度調節的功能，將發芽床送入種子發芽箱之后，可以按照技術規定的溫度等條件和天數來進行發芽試驗，避免了外界自然環境對于種子發芽的影響，另外，在中發芽試驗來時之后，種子發芽箱還可以保持種子發芽所需的水分和溫度，進而通過檢查，按規定的發芽勢和發芽率的截止日期，及時檢查正常與不正常的發芽種子，做好記錄。
由此可見，種子發芽箱在種子發芽率測定中的所扮演的角色，還是十分重要的。我們知道合適時的生長環境可以促進種子的萌發，種子發芽箱不僅能夠為種子發芽提供合適的環境條件，而且具有監測、控溫和保護等功能，可以更加直觀的觀察箱體內的種子發芽情況，方便了種子發芽率測定試驗的進行。
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