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在生產中，選用發芽率高的種子播種，可以有效確保種子的利用率，提高種植品質，降低生產成本，因此種子發芽率是農戶選擇種子往往會重點考慮的一個參數。在種子生產中，種子公司為了科學開展種子實驗，獲得準確的種子發芽率結果，往往會采用專業的發芽箱開展實驗。種子發芽箱可以根據不同的種子發芽需求，合理的進行溫濕度調節，以滿足種子發芽率實驗對發芽條件的準確要求。
種子發芽率也是判斷種子品質的一個很重要標準，因此上市銷售的種子發芽率達標是一個隱形要求，因此不僅種子企業會使用發芽箱來檢測種子發芽率，種子監管部門也會時常對種子抽檢，在實驗室中使用發芽箱檢測種子發芽率，因此發芽箱幾乎成了開展種子發芽率檢測的*，在種子生產、質量監管以及種子科研等方面 應用十分廣泛。
種子發芽需要環境的支持，在不同的環境條件下，種子的發芽率是有差別的，而在自然界中，溫度、濕度等往往是瞬息萬變，難以恒定，因此要測定理想環境下的種子發芽情況，計算種子發芽率并沒有那么容易。而發芽箱的出現，為人工進行箱體內的溫濕度等環境調控提供了技術支持，并且能夠為不同種子發芽率實驗提供所需要的發芽條件。在開展檢測之前，我們只需要選好100粒種子，并將它們整齊排放在發芽皿中，放入發芽箱，然后通過簡單的設置，既可開始種子發芽試驗。發芽箱提供的是一個可靠的恒溫環境，因此使用發芽箱測定種子發芽率，*不同擔心環境干擾，測定結果也更接近真實值，是準確判斷種子品質的理想儀器。
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