細胞生物學：細胞凋亡研究；定量分析細胞周期并分選不同細胞周期時相的細胞；分析生物大分子如DNA、RNA、抗原、癌基因表達產物等物質與細胞增殖周期的關系，進行染色體核型分析，并可純化X或Y染色體。

  免疫學：研究細胞周期或DNA倍體與細胞表面受體及抗原表達的關系；進行免疫活性細胞的分型與純化；分析淋巴細胞亞群與疾病的關系；免疫缺陷病如艾滋病的診斷等。

  腫瘤學：DNA倍體含量測定是鑒別良、惡性腫瘤的特異指標。

  血液學：血液細胞的分類、分型，造血細胞分化的研究，血細胞中各種酶的定量分析，如過氧化物酶、非特異性酯酶等；用NBT及DNA雙染色法可研究白血病細胞分化成熟與細胞增殖周期變化的關系，檢測母體血液中Rh(+)或抗D抗原陽性細胞；檢測血液中循環免疫復合物可以診斷自身免疫性疾病。

  藥物學：檢測藥物在細胞中的分布，研究藥的作用機制，亦可用于篩選新藥。