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由酶聯免疫吸附實驗法可知，酶標儀應該用比色法來分析抗原或抗體的含量，即它應依照比色原理進行工作。實際上，酶標儀就是一臺變相的光電比色計或分光光度計，其基本工作原理與主要結構和光電比色計幾乎相同。
FC酶標儀所用的單色光既可通過相干濾光片來獲得，也可用分光光度計相同的單色器來得到。在使用濾光片作濾波裝置時與普通比色計一樣，濾光片即可放在微孔板的前面，也可放在微孔板的后面，其效果是相同的。光源燈發出的光經聚光鏡，光欄后到達反射鏡，經反射鏡作90°反射后垂直通過比色溶液，然后再經濾光片送到光電管。
酶標儀可分為單通道和多通道兩種類型，FC酶標儀屬于單通道酶標儀，單通道又有自動和手動兩種分類。自動型的儀器有X，Y方向的機械驅動機構，可將微孔板L的小孔一個個依次送入光束下面測試，手動型則靠手工移動微孔板來進行測量。
FC酶標儀在食品衛生，農業以及畜牧行業可檢測的項目主要有營養成分、添加劑、農藥殘留量、菌毒素、無機毒素、抗生素激素殘留、致癌物質殘留、有毒有害物質污染等。在醫療行業可檢測的項目主要分為以下幾種：
一、過敏原：皮膚不耐受等；
二、甲狀腺：促甲狀腺激素，T3T4等；
三、糖尿病：C肽，胰島素，胰島素抗體，胰島素原等；
四、弓形蟲抗體，巨細胞病毒，風疹病毒等；
五、性激素六項，泌乳素，雌三醇，生長素等；
六、傳染病類：例如肝炎，艾滋病，衣原體，肺炎支原體，梅毒，水痘等；
七、腫瘤標志物：癌胚抗原，甲胎蛋白，乳腺癌，卵巢癌，膀胱癌，胃腸癌等。
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