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單細胞培養重要的是把但一個目標細胞從群體細胞群中高精準、高純度、高存活率地分選捕獲出來然后培養分析，培養方法以在直接在培養碟中，以電腦自動控制單細胞微吸吮捕獲、沉積分選培養模型為宜，也是可以是用培養分析跟蹤板或使用把顯微鏡升級改造為納米激光鑷捕獲操縱單細胞模型。
細胞培養是指酵母菌、細菌等單細胞生物的培養，或取多細胞生物體上的一個細胞的無菌培養，從多細胞生物中得到單細胞的辦法是，開始對切離的組織的初始培養物進行振蕩培養，然后在連續培養中用適當的篩孔將游離的細胞分篩出來，再將收集起來的游離的單細胞懸浮在液體培養基中，用微量吸管吸取一個細胞。動物細胞的單細胞培養時，要適當稀釋接種，為使得到的單細胞進行增殖，可以采用微量培養法和保護培養法，對浮游的單細胞群進行平面培養。
單細胞培養利用固體瓊脂培養基對植物的離體組織進行培養的方法在植物遺傳實驗中已經得到廣泛的應用。當植物的組織在液體培養基中生長時，可以通過薄層震蕩培養或向培養基中通氣用以改善培養基中氧氣的供應，植物細胞的懸浮培養是指將植物細胞或較小的細胞團懸浮在液體培養基中進行培養，在培養過程中能夠保持良好的分散狀態。這些小的細胞聚合體通常來自植物的愈傷組織。
在繼代培養時，應將較大的細胞團塊和接種物殘渣除去，若從植物器官或組織開始建立細胞懸浮培養體系，就包括愈傷組織的誘導、繼代培養、單細胞分離和懸浮培養，廣泛應用于細胞的形態、生理、遺傳、凋亡等研究工作，特別是為基因工程在植物細胞水平上的操作提供了理想的材料和途徑。經過轉化的植物細胞再經過誘導分化形成植株，即可獲得攜帶有目標基因的個體。
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