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二級生物安全柜的作用就是有效地降低實驗室獲得性感染的機會，減少人與樣品或樣品與樣品之間交叉污染的機會，用于保護操作人員，保護實驗室環境，保護實驗材料的生物安全。
在臨床實驗室，操作感染性標本時或作病原體分離培養、制備菌種時會因為樣品的振蕩、搖動、傾注、攪拌、移液等操作或液體的灑落，產生肉眼看不見的氣溶膠或產生直徑為5～100腫的液滴，這些微粒中含有活的致病微生物，可以被操作者吸入或污染工作臺面上的其他樣品。
準備工作
1.在開始工作以前，要清除生物安全柜內表面的污染。
2.將所有必需的物品置于安全柜內，以盡可能減少雙臂進出前面開口的次數。物品放置要注意以下幾點：
?、俣壣锇踩衽_面前面和后面的進氣格柵不能被物品阻擋。
?、谒形锲窇M可能地放在工作臺后部靠近工作臺邊緣的位置，并使其在操作中不會阻擋后部格柵。
③可產生氣溶膠的設備(如：混勻器、離心機等)應靠近安全柜的后部放置。有生物危害性的廢棄物袋、盛放廢棄吸管的盤子等體積較大的物品，應該放在安全柜內的某一側。
?、軡崈舻奈锲窇胖迷诰嚯x產生氣溶膠器皿至少15 cm外，降低交叉污染的可能性。
⑤容易受紫外線損傷的實驗樣本可以在紫外線殺菌后的實驗之前放入。
?、薏灰诠ぷ鲄^內排放過多的物品。
3.關閉操作前窗，打開紫外燈，對工作臺面，側壁表面以及后壁內側進行殺菌處理。
4.稍微打開操作前窗，讓工作區排氣幾分鐘之后再開始工作。
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