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醫用生物安全柜的保護作用是關機鍵，如果設備的保護作用喪失，使用這種設備也就失去了實際意義。所以在應用這種設備的時候，一定要對其狀態給予關注，這樣一方面可以避免設備使用中出現問題，一方面也可以在設備出現故障的時候及時的進行解決。
這要求使用此種設備的人員都是專業人員，對設備如何應用細節方面都有一定的了解與認識，實際應用設備的時候可以嚴格的按照有關規定進行，避免設備由于操作不當而出現問題。
一旦設備出現故障，應當及時的對試驗中應用的各種原材料進行處理，一方面防止其被污染，一方面也要防止原材料污染周邊環境。同時要及時的與設備的生產廠家，讓廠家來對設備進行進一步的檢修，解決設備使用中遇到的故障問題。
有些實驗人員會感覺自己對這種設備已經很了解了，自己對其進行檢修就可以，這一點一定要注意，因為如果是自己盲目的檢修，很可能會給設備帶來更大的損害，也容易使自身健康受到影響，所以讓廠家來處理問題很重要。
醫用生物安全柜一般由箱體和支架兩部分組成。箱體部分主要包括以下結構：
1、空氣過濾系統：
空氣過濾系統是保證本設備性能主要的系統，它由驅動風機、風道、循環空氣過濾器和外排空氣過濾器組成。其主要的功能是不斷地使潔凈空氣進入工作室，使工作區的下沉氣流(垂直氣流)流速不小于0.3m/s，保證工作區內的潔凈度達到100級。同時使外排氣流也被凈化，防止污染環境。
該系統的核心部件為HEPA過濾器，其采用特殊防火材料為框架，框內用波紋狀的鋁片分隔成柵狀，里面填充乳化玻璃纖維亞微粒，其過濾效率可達到99.99%以上。進風口的預過濾罩或預過濾器，使空氣預過濾凈化后再進入HEPA過濾器中，可延長HEPA過濾器的使用壽命。
2、外排風箱系統：
外排風箱系統由外排風箱殼體、風機和排風管道組成。外排風機提供排氣的動力，將工作室內不潔凈的空氣抽出，并由外排過濾器凈化而起到保護樣品和柜內實驗物品的作用，由于外排作用，工作室內為負壓，防止工作區空氣外逸，起到保護操作者的目的。
3、滑動前窗驅動系統：
滑動前窗驅動系統由前玻璃門、門電機、牽引機構、傳動軸和限位開關等組成，主要作用是驅動或牽引各個門軸，使設備在運行過程中，前玻璃門處于正常位置。
4、照明光源和紫外光源位于玻璃門內側以保證工作室內有一定的亮度和用于工作室內的臺面及空氣的消毒。
5、控制面板上有電源、紫外燈、照明燈、風機開關、控制前玻璃門移動等裝置，主要作用是設定及顯示系統狀態。
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