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在新時代的條件下，經濟的發展帶動了科技的發展進步，在環境檢測中雙系統離子色譜儀已經進入了廣泛使用，因此離子色譜技術已得到充分的研究和發展空間，逐漸在許多地方應用，其在環境監測中的應用也非常廣泛，有效提高環境監測水平。隨著科學技術水平的迅速發展，環境監測不僅是對簡單的有機物進行分離和監測，而且包含了對環境中的無機物進行分離與監測。已成為環境監測中最重要的技術之一。
根據當前的環境保護標準，在涉及陰離子和陽離子分析的大氣、水、土壤和其他環境測試中，許多地方還是在利用經典方法進行檢測，比如，進行使用分光光度法和電極法，這些方法在處理各種復雜的化合物比較有效。隨著社會對環境監測要求越來越高，在環境監測的過程中要保證數據的準確性，而且還要對分析方法進行改進，而科學技術的發展使得雙系統離子色譜儀已經成為了環境檢測的重要儀器，利用離子色譜儀不僅能夠提高環境檢測數據的有效性和準確性，而且具有高效率，往往需要的樣品量很少，就能夠進行檢測，并且具有無污染、靈敏度高等特點，目前這種方法已經被廣泛應用在了對工業廢水、飲用水以及工業生產中產生的廢氣的檢測當中。
雙系統離子色譜儀工作流程基本大同小異。其流程主要為：
(1)對淋洗液系統進行必要檢查，打開氬氣氣瓶開關，調節減壓閥指示為0.2-0.3Mpa;打開淋洗液系統氣源裝置，調節減壓閥，使指示表顯示為3-6PSi。
(2)分別按順序打開主機-電腦-打印機等設備電源開關，對設備進行上電操作。
(3)系統處理及控制系統上電接通后，進入操作界面，并進入系統操作面板，準備操作前的準備及管理工作。
(4)打開泵。如色譜分析儀長時間不使用或更換淋洗液后，要先打開平衡泵頭上的PRIME閥排氣后再開泵，待泵壓力穩定后再打開yi制器電源。
(5)在進入色譜柱之前通過進樣器將樣品導入,流動相將樣品帶入色譜柱,在色譜柱中各組分被分離,并依次隨流動相流至檢測器。
(6)檢測器檢測到的信號送至數據系統，利用操作界面做完樣后，選擇檢測標準進入數據處理，對采集數據進行記錄、處理、打印或者保存等操作。
(7)關機，系統關機需要根據檢測樣品不同選擇不同關機步驟。對于陰陽離子，需要先將抑制器電流關掉，然后再關泵，Z后關主機。
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