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根據酶聯免疫吸附試驗方法,酶標檢測儀應該使用比色法分析抗原或抗體的內容,也就是說,它應該根據比色原理工作。事實上，酶標檢測儀是一種變相的光電比色計或分光光度計，其基本工作原理與光電比色計的主體結構和基本原理幾乎相同。
酶標儀所使用的單色光可以通過相干濾光片或與分光光度計相同的單色器獲得。用濾光片作為濾光裝置時，與普通比色計相同。濾光片可以放置在微孔板前面，也可以放置在微孔板后面，效果是一樣的。光源燈發出的光經過聚光鏡和光闌到反射鏡，被反射鏡反射成90°，垂直穿過比色溶液，然后通過濾光片送到光電管。
酶標分析儀可分為單通道和多通道兩種類型。單通道酶標儀分為自動酶標儀和手動酶標儀。自動式儀器在X、Y方向設有機械驅動機構，可將微孔板L的小孔逐個送至橫梁下進行檢測，手動式儀器則是利用微孔板手動移動微孔板進行測量。
在食品衛生、農牧行業，酶標檢測儀的檢測項目主要包括營養素、添加劑、農藥殘留、細菌毒素、無機毒素、抗生素激素殘留、致癌物殘留、有毒有害物質污染等。醫療行業可檢測的項目主要分為以下幾類:
1.過敏原:皮膚不耐受等;
2.甲狀腺:促甲狀腺激素、T3T4等;
3.糖尿病:c肽、胰島素、胰島素抗體、胰島素原等;
4.弓形蟲抗體、巨細胞病毒、風疹病毒等;
5.六種性激素，催乳素、雌三醇、生長激素等;
6.傳染病:如肝炎、艾滋病、肺炎衣原體、支原體、梅毒、水痘等;
7.腫瘤標志物:癌胚抗原、甲胎蛋白、乳腺癌、卵巢癌、膀胱癌、胃腸道癌等。
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