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偏光顯微鏡的調節與校正時，一、要先對目鏡和物鏡進行調節。對于只有一個目鏡筒的偏光顯微鏡，只要將選用的目鏡插入鏡筒，使目鏡十字絲位于左右、上下方向即可。對于具有雙目鏡筒的偏光顯微鏡，還需調節兩個目鏡之間的距離，使眼睛間距與雙筒視線一致。因顯微鏡類型不同，物鏡的裝卸有下列幾種情況：彈簧夾型、轉盤型、螺絲扣型。
二、調節照明系統。分以下兩種情況：1)有自然光照明，則需要調節反光鏡。反光鏡有平面鏡和凹面鏡兩種。2)用人工光源照明，如OLYMPUS和ZEISS等高級顯微鏡都用人工光源照明，需要調節電壓旋鈕，電壓越高，亮度越大。
三、調節焦距。調焦時，需從側面看鏡筒，轉動粗調旋鈕，將鏡頭降至低位置，若用高倍鏡頭，需將鏡頭降至幾乎與薄片接觸為止，然后從鏡中觀測，同時轉動粗旋鈕緩緩提升鏡頭至視域內物像基本清楚，在轉動微調旋鈕，直至視域內物像清晰為止。須注意的是，調焦時，絕不能眼睛看著鏡筒內下降鏡第四步，校正中心。
五、視域直徑的測定。分三種情況：1)對于低倍或中倍物鏡的視域直徑，可用透明三角板直接測定。2)對于高倍物鏡的視域直徑，可用物臺微尺測定。3)對于帶有刻度的目鏡，可直接測定。
六、目鏡十字絲的檢查。主要檢查目鏡十字絲是否正交。因為目鏡十字絲正交與否關系到偏光顯微鏡中的上、下偏光的振動方向是否垂直。
七、偏光鏡的校正，有以下三個內容：1)確定及校正下偏光鏡的振動方向。2)檢查上、下偏光鏡的振動方向是否垂直。3) 檢查目鏡十字絲是否嚴格與上、下偏光振動方向一致。
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