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超聲波清洗器是利用超聲波發生器所發出的交頻訊號，通過換能器轉換成了交頻機械振蕩而傳播到介質——清洗液中，強力的超聲波在清洗液中以疏密相間的形式向被洗物件輻射。產生“空化”現象，即在清洗液中“氣泡”形式，產生破裂現象。當“空化”在達到被洗物體表面破裂的瞬間，產生遠超過1000個大氣壓力的沖擊力，致使物體的面、孔、隙中的污垢被分散、破裂及剝落，使物體達到凈化清潔。主要適用于商業、輕工、大專院校、科研用小批量的清洗、脫氣、混勻、提取、細胞粉碎之用。
超聲波清洗器和超聲波細胞破碎儀其主要原理是相通的，主要區別是超聲波細胞破碎儀把所有的能量集中在探頭上，而超聲波清洗器的能量則是均勻的分布在清洗槽的底部，因此，超聲波清洗器更傾向于脫氣和清洗，而超聲波細胞破碎儀則傾向于細胞破碎、乳化及均質。
超聲波清洗器可以實現同時數顯超聲液位、溶液溫度、超聲頻率、超聲時間、超聲功率；數顯超溫度、超電壓、超電流保護指示。清洗器具有揮發性水蒸氣自動回收裝置。
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