1、組織勻漿
(1) 取出高溫高壓消毒后研缽,切取50-100mg冰凍組織置于研缽內,倒入液氮,研碎。
(2) 每50-100mg均漿組織標本中加入1ml的TRIZOL,標本的量不能超過TRIZOL體積的10%,否則會出現DNA污染。
(3) 將以上勻漿標本轉移到1.5ml的EP管中,在15- 30°C放置5分鐘,以*分離核蛋白復合體。
2、相分離
加入0.2 ml的CHCl?,加蓋好后用手劇烈搖晃15秒,在15- 30°C放置2-3分鐘,然后離心 12,000× g,15 minutes , 2 - 8°C。離心后分成三層,下面的紅色為酚-CHCl?相,一個中間層,一面是無色的水相。RNA只存在于水相中。水相占總TRIZOL的60%。
3、RNA沉淀
將上層水相轉移到另一干凈的EP管中, 加入0.5ml異丙醇,靜置10 minutes ,15 -30°C,然后離心12,000 × g ,10 minutes, 2 - 8°C。離心前可以在管的側壁和底部看到絮狀膠樣沉淀,這就是RNA沉淀。
4、RNA洗滌
去上清, 加入1ml 75%乙醇洗滌RNA沉淀,振蕩器混勻,離心7,500 × g ,5 minutes,2 -8°C。
5、RNA再溶解
去上清,置真空或空氣中5-10分鐘,干燥RNA沉淀,(不能在真空中離心干燥)。注意不能將RNA沉淀*干燥,這樣會大大降低它的溶解度。部份溶解的RNA樣品其A260/280 ratio < 1.6。
用無RNase 水或0.5% SDS溶液重懸RNA沉淀,用槍頭反復吹打幾次,靜置10分鐘,55-60°C。測濃度后-20°C保存。
6、測濃度: 取2μl 儲存液加入另一個EP管中,再加入98μl無RNase水,離心混勻,以無RNase水作空白對照,測OD260/280值。1 OD=40μg RNA。OD260/280值在1.8-2.0視為純度很高。一般濃在1000ng/ml較準。濃度太高要稀釋以后再測定。
7、RNA鑒定:甲醛變性瓊脂糖電泳,確定抽提RNA完整性和DNA污染情況。
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