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氣相色譜質譜聯用儀作為質量檢測器可以取代色譜儀的多種檢測器，通用性強，使用十分方便。而色譜儀有很多檢測器，如TCD、FID、ECD、FPD、NPD等，每種檢測器只有一定限度的適用范圍，不能通用，造成使用不便。所以說氣相色譜質譜聯用儀把色譜的高效分離作用與質譜計對未知樣品的準確鑒別能力相結合，把分析儀器提高到一個新水平，凡是能使用色譜儀的地方，均可以使用氣相色譜質聯用儀器。
氣相色譜質譜聯用儀的運行依據：
為了質譜儀器的正常工作，必須要組成高真空系統的真空室。儀器使用了高性能的渦輪分子泵與前級真空泵構成兩級真空機組以確保所需的真空。被分析樣品經毛細管柱分離，進入離子源。采用電子電力標準配置(EI)，產生正離子，在推斥、聚焦、引出電極的作用下將正離子送入四極桿系統。四極桿在高頻電壓與正負電壓聯合作用下形成高頻電場，在掃描電壓作用下，只有符合四極場運動方程的離子才能通過四極桿對稱中心到達離子檢測器，再經離子流放大器放大，產生質譜信號。得到了質譜圖，通過解釋譜圖或進行譜庫檢索以識別未知樣品的組成。
氣相色譜質譜聯用儀的應用范圍：
1、應對各種突發事件，如有害物質泄漏、重大環境災害等
2、凡是需要氣相色譜儀進行檢測的場合，特別是對未知樣品進行定性分析的地方
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