HOP、Pry和DPD：骨組織中CTX或NTX通過吡啶啉或脫氧吡啶啉連接相鄰兩個1型原膠原分子。在膠原分子內部，羥脯氨酸通過氫鍵發揮穩定膠原纖維的作用。在骨吸收過程中，1型膠原降解，會釋放出HOP、Pry和DPD，因此其是反映破骨細胞活性的骨吸收標志物。HOP主要在肝臟代謝，約10%的羥脯氨酸經尿液排出。由于HOP既來自骨吸收時1型膠原的降解，又來自皮膚、軟骨等多種組織的分解代謝，因此HOP并非骨特異性標志物，臨床上已較少使用［17］。Pry和DPD是穩定膠原之間鏈接的分子，骨吸收過程中，膠原分子鏈接被蛋白水解破壞，Pry和DPD釋放入血，在尿液中可被檢測到。絕大多數DPD存在于骨骼和牙本質，而Pry除骨骼外，還來源于韌帶、軟骨和血管等，因此，DPD較Pry能更特異地反映骨吸收水平［16］。

CTX或NTX：1型膠原分子間交聯物能夠穩定膠原結構，其羧基端片段CTX有α-CTX和β-CTX兩種，β-CTX是α-CTX的異構體。在骨吸收過程中，CTX和NTX隨著1型膠原分子的降解而釋放入血，可經尿液排泄，故血液及尿液中的CTX和NTX濃度能夠特異性反映骨吸收水平，由于β-CTX作為骨吸收標志物的研究更多，其為敏感而特異的骨吸收標志物［19］。

TRAP 5b：TRAP 5b是破骨細胞產生的酶類。骨吸收過程中，膠原降解產物被破骨細胞吞入，并與含有TRAP 5b的細胞囊泡融合，被TRAP 5b產生的氧化應激產物破壞，并和TRAP 5b一起分泌到細胞外。TRAP 5b主要在肝臟代謝，血清TRAP 5b水平能較好地反映破骨細胞的骨吸收活性［14］。