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熒光顯微鏡是免疫熒光細胞化學的基本工具。是由光源、濾板系統和光學系統等主要部件組成。熒光顯微鏡利用一定波長的光激發標本發射熒光，通過物鏡和目鏡系統放大以觀察標本的熒光圖像。熒光顯微鏡用于研究細胞內物質的吸收、運輸、化學物質的分布及定位等，廣泛應用于生物，醫學等領域。
組成部分：
(A)光源：光源幅射出各種波長的光(從紫外至紅外)。
(B)激發濾光源：透過能使標本產生熒光的特定波長的光，同時阻擋對激發熒光無用的光。
(C)熒光標本：一般用熒光色素染色。
(D)阻擋濾光片：阻擋掉沒有被標本吸收的激發光有選擇地透射熒光，在熒光中也有部分波長被選擇透過。
熒光顯微鏡使用的注意事項：
a.激發光長時間的照射，會發生熒光的衰減和淬滅現象，因此盡可能縮短觀察時間，暫時不觀察時，應用擋板遮蓋激發光。
b.作油鏡觀察時，應用"無熒光油"。
c.熒光幾乎都較弱，應在較暗的室內進行。
d.電源最好裝穩壓器，否則電壓不穩不僅會降低汞燈的壽命，也會影響鏡檢的效果。
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