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CPB沉淀法純化放射性標記的寡核苷酸實驗

來源:深圳市安培生物科技有限公司   2021年12月20日 10:23  

材料與儀器

十六烷基溴化吡啶 EDTA-Tris EDTA-Tris-DNA 溶液 乙醇-乙酸鈉溶液 乙醇 乙酸鈉 TE(pH7.6) 或適當的預雜交液 核酸和寡核苷酸 純化的原料
干冰 乙醇浴

步驟

材料

溶液和緩沖液
稀釋貯存液至適當濃度。

十六烷基溴化吡啶(CPB)1%,m/V)
將 1 gCPBW(sigma 公司)溶于 100 ml 水中,加熱并用磁力攪拌器攪拌溶液可加速溶解。待去污劑全部溶解后,將溶液冷卻至室溫,用硝酸纖維素濾膜過濾(0.45um 孔徑)

EDTA-Tris(0.5mol/L,pH6.0)
用 60 ml 水溶解 0.1mol EDTA, 在攪拌溶液的同時, 加入 Tris 堿(粉末),直到溶液 pH 值達到 6.0, 此時 Tris 的濃度為約 1.2mol/L。加水使溶液的體積為 200 mL。這不同于常規配制方法,但對于陽離子去污劑有效地沉淀核酸是非常必要的(Sibatani1970)。

EDTA-Tris-DNA 溶液
用 50 mmol/LEDTA-Tris(pH6.0)(1:10 稀釋 0.5mol/LEDTA-Tris 溶液)溶解載體 DNA(鮭精DNA), 使其濃度為 50ug/ml 載體 DNA 應大小均一、不干擾放射性標記核酸與靶 DNA 的雜交。用超聲處理或鮭精 DNA 片段可滿足多數實驗的要求(超聲處理鮭精 DNA 的長度在 600~5000bp,可以從 Pharmacia 公司購得或按第 6 章的方案 10 制備)。

乙醇-乙酸鈉溶液

80%(V/V) 乙醇

20%(V/V) 乙酸鈉(0.1mol/L,pH5.2)

TE(pH7.6) 或適當的預雜交液
見步驟 8。

核酸和寡核苷酸

放射性標記的寡核苷酸

純化的原料是方案 2(步驟 3 或步驟 5) 的反應混合液,T4 噬菌體多核苷酸激酶已在 68°C 滅活。

專用設備

干冰/乙醇浴

方法

1. 含有放射性標記的寡核苷酸的微量離心管中加入 5~10 倍體積的 EDTA-Tris-DNA 溶液,充分混合。
為進行有效的沉淀,務必使終末反應混合液中 EDTA-Tris-DNA 溶液的離子成分占優勢,混合液的終體積與放射性標記寡核苷酸的濃度對本方法的效率不產生影響。

2. 加入足量的 1%CPB, 使離心管中混合液的去污劑濃度達到 0.1%, 充分混勻。

3. 將離心管置于干冰/乙醇浴中至混合液凍結。從冰浴中取出離心管,室溫下使混合液融化。

4.4°C 下以最大轉速離心 5 min, 用巴斯德吸管或裝有一次性藍吸頭的微量移液器小心吸去管中的上清。
警惕:上淸中含大部分未摻入的 [γ-32P]ATP。磷酸化反應常使用大于100uCi 的放射性標記 ATP,因此上清中放射性劑量相當可觀,應小心謹慎處理未摻入的放射性物質、移液器吸頭及離心管。

5. 在管中加入 500ul 蒸餾水,振蕩 20s, 再次按步驟 4 離心。

6. 吸去管中上清,加入 500ul 乙醇-乙酸鈉溶液,振蕩 15s,隨后在室溫下以最大轉速離心 2 min。

7. 重復步驟 6。

8. 小心吸去上清。打開離心管蓋,放置在試驗臺聚異丁烯酸樹脂有機玻璃防護屏后,直到剩余可見的乙醇揮發干凈。用 20~50ulTE(pH7.6) 溶解沉淀的寡核苷酸。如放射性標記的寡核苷酸用作探針,則用小體積預雜交液溶解。

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安培生物堅持為生命科學研究、活體動物轉染、大規模生物生產、基因和細胞治療領域客戶,提供*細胞體內可代謝的核酸轉染試劑;inviCELL™Platelet lysate無動物血清產品旨在支持廣泛的細胞擴增和生產,包括培養間充質干細胞和多種免疫細胞系等,為制藥公司或者生物技術公司提供無血清細胞培養規模生產服務;提供以植物生物為平臺基因序列全人源化、*的細胞培養可分解3D基質膠產品;提供內毒素≦ 1.0 EU/mL、對細胞無毒性影響、高純度的一型膠原蛋白產品。安培生物專注為生物醫藥領域提供優質的產品和技術服務,努力發展為基因治療、細胞治療的生物科技企業。


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