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高效液相色譜儀是分析實驗室常用的測試儀器之一，其應用越來越廣泛。高效液相色譜儀在使用過程中，難免會出現各種各樣的問題，并將直接影響到所測數據的準確性和儀器的正常工作。
1、試管的潔凈問題：
高效液相色譜儀分析法是一個很靈敏的分析方法，如果因使用不潔凈的試管，便會影響試驗結果的準確性。例如，在用甲醇作溶劑來溶解樣品時，所用的小試管是用橡膠塞來做蓋子的，因此，在每次進樣時，都有一個保留時間固定的干擾峰存在，后經證實，此干擾峰是由甲醇浸泡橡膠塞而溶下的組分所產生，換用玻璃試管后，干擾峰消除。
2、塑料試管的溶解問題：
近年來，一次性塑料試管給試驗人員帶來了方便，但是，在使用過程中一定要注意有機溶劑對試管的溶解現象，在利用此種試管提取樣品時，有些有機溶劑(如氯仿等)對管壁有溶解現象，這些被溶解下來的物質有時也能在檢測器上產生信號，從而干擾樣品的測定。這時，可用相同的實驗條件先行試驗一下，看看不含被抽提物時，提取液在檢測器上能否產生干擾信號，如確有干擾信號存在，就只能換用耐有機溶劑的玻璃試管了。
3、被測樣品在試管壁上的吸附問題：
這個問題也應引起注意，否則也會影響測試結果的準確性，在ZL藥物監測中，有些被測藥物如，丙咪嗪等易吸附在玻璃試管的管壁上，因此，操作中宜采用聚丙烯管，為防止提取中吸附現象的發生，可采用0.5%的已二胺已烷液做為提取劑，可有效地防止吸附。
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