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Rxi毛細柱明顯好于填充柱，口徑越細，效果越明顯。由于毛細管柱內徑極小，有效地解決了柱內擴散效應，使得鋒形尖銳，分離度好。毛細管柱柱效高，分離性能好，可一次分離的組分多，柱容量小，通常情況要分流進樣。
Rxi毛細柱是填充色譜柱的升級產品，毛細管色譜柱在各方面的性能都比填充柱高出許多，但目前毛細管色譜柱也不能*取代填充色譜柱，填充色譜柱也有它的優勢。
這主要是由于一般毛細管柱的樣品負荷量比填充柱底1~3個數量級。要求分流進樣(分流進樣一般不適用于沸程超過十個碳數的混合物)。Crob無分流進樣法，雖在一定程度上克服了分流進樣的不足，但操作不便，使用上也有一定限制。另外，填充柱可選用上百種固定液，以改善柱的選擇，使之滿足分析上的要求。這些可能就是毛細管柱至今還不能普遍替代填充柱的主要原因。
相比于填充柱，毛細管柱具有更高的理論及有效塔板數。對于幾乎所有的樣品，毛細管柱效更高，從而大大改善了峰的分離度，分離能力大幅提高使許多分析能夠在非常短的時間內用非常短的色譜柱來完成。
0.53mm大口徑毛細管柱大大減少了填充柱與毛細管柱在樣品容量上的差別，而且近年來檢測器敏感度的提高也降低了大樣品量的需求。0.53mm大口徑毛細管柱已廣泛應用，正在越來越多地替代填充柱。
與填充柱比，毛細管具有近似填充柱的負荷量。液膜厚度為1.0μm的大口徑的樣品負荷量，接近配比為5%內徑為2.16mm的填充柱。只要解決好進樣口和檢測器的死體積。0.53mm大口徑柱*可以不采用分流進樣方式。可以通過調節液膜厚度，來適應于輕組份(厚液膜)或重組份(薄液膜)的分析。
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