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快速動力學停流的工作原理就是樣品快速混合單元將各反應物在氣動裝置的作用下快速推進，經噴嘴在短時間內*混合后，流入反應觀察池，并突然停止流動，通過測定溶液的某一特性（如吸光度、電導等）隨時間的變化來監測反應進程。對于停流光譜儀中發生的臭氧-有機污染物液相均相反應，可簡單表示為：aA+B→pP，其中A、B、P分別代表有機臭氧、污染物和氧化產物，a與p為反應計量系數。
快速動力學停流分析的一個優點是快速：
盡管有的化學反應很慢，甚至反應的半壽期長達幾個小時，但用停流法可測定反應開始幾秒鐘內的反應速度，從而迅速的測出待分析物的濃度。而基于同一反應的平衡方法，則要等反應達平衡后才能測定，相比之下就慢得多。特別是停流法與計算機或微處理機結合，可以自動地進行樣品的配制、樣品和試劑的取樣及混合、數據的捕獲及處理。這不僅解除了繁雜的人工操作，而且既快速，重復性又好，大大加快了分析速度，提高了分析精度。
如用自動停流法測定磷酸鹽和Mo（V）在強酸介質中生成12-鉬磷酸的初始速度，檢測磷酸鹽的濃度，測量時間只用0.3秒，而整個樣品的分析時間也僅為0.7秒，這樣每小時能分析幾千個樣品，相對標準誤差在2-3%的范圍內。同一樣品的多次重復測量，可使其相對標準誤差降至1%以下。該方法還被實際用來測定血液中磷的含量，所用的樣品少，0.2ml的血液樣品足以進行約100次的測定，多次測定的平均值可使測量的精度在0.5-3%范圍內。
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