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臺式掃描電鏡利用極細電子束在被觀測樣品表面上進行掃描，通過分別收集電子束與樣品相互作用產生的一系列電子信息，經轉換、放大而成像的電子光學儀器，是研究三維表層構造的有利工具。
在高真空的鏡筒中，由電子槍產生的電子束經電子會聚透鏡聚焦成細束后，在樣品表面逐點進行掃描轟擊，產生一系列電子信息（二次電子、背反射電子、透射電子、吸收電子等），由探測器將各種電子信號接收后經電子放大器放大后輸入由顯像管柵極控制的顯像管。
聚焦電子束對樣品表面掃描時，由于樣品不同部位表面的物理、化學性質、表面電位、所含元素成分及凹凸形貌不同，致使電子束激發出的電子信息各不相同，導致顯像管的電子束強度也隨著不斷變化，從而在顯像管熒光屏上可以獲得一幅與樣品表面結構相對應的圖像。
根據探測器接收的電子信號的不同，可分別獲得樣品的背散射電子圖像、二次電子圖像、吸收電子圖像等。掃描電鏡分辨率可達50~100Å，電子放大倍數可由十幾倍連續變化到幾十萬倍。因此可以對樣品的整個表面進行比較仔細的觀察。
調查表明接近90%的掃描電鏡圖片是在2萬倍以下拍攝的，因此，臺式掃描電鏡可以滿足絕大多數傳統SEM用戶的需求，其應用領域廣泛，包括：粉末、金相、制藥、造紙、半導體、微電子、生命科學……
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