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當面對一個未知物時，先試用現有GC柱，如果該柱分離不理想，根據你對樣品的了解，基本原則是分析物與固定相有相似化學性質時才會相互作用。這說明對樣品越了解，越容易找到合適的固定相。
非極性分子——通常僅由C和H組成并且無偶極矩，直聯(正烷)是常見的非極性化合物的例子。
極性分子——主要由C和H組成同時也有其他原子，如：N、O、P、S或鹵素。樣品包括有醇類、胺類、硫醇類、酮類、有機鹵化物等。
可極化物質——主要由C和H組成同時包含不飽和鍵。通常有：炔和芳香族化合物。我公司提供的色譜柱品種齊全，能夠*你分析的需要。
如果你的樣品是具有相似的化學性質的非極性組分的混合物，比如大多數石油餾分中的烴，你可以試用SE-30毛細管色譜柱，它按沸點順序分離。如果你懷疑有芳族化合物，試著用有苯基的SE-54或OV-35柱。
極性或可極化組分樣品能夠在中極性和/或可極化固定相色譜柱上進行分析，如有苯基或類似基團固定相。如果需要更高極性，可以選用聚乙二醇(PEG)固定相，即通常所說的WAX固定相。
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