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1)在pH值正常范圍內(2~8)可選用現代高純硅膠色譜柱，具有峰形好，重現性高和壽命長的特點，選用較短的柱子可以提高分離效率，選用較長的柱子可以增加保留，選用小顆粒度的填料可以提高分離度，對分子量大的組分宜選用大孔徑填料的色譜柱。
2)分離極性大的組分(流動相水相過大)采用AQ類似的色譜柱。
3)分離生物堿類的化合物選用經過烷基化處理封口的填料可防止堿性化合物的拖尾現象。
4)極端酸性條件下(pH小于2)選用Zorbax Stable Bond C18類色譜柱或者寬pH值色譜柱。
5)低端堿性條件下(pH大于8)選用Zorbax Extend-C18、XBridge，XSelect，Atlantis，Symmetry，XTerra，SunFire等色譜柱。
6)選用含碳量高的柱子可以增加保留。
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