細胞外的黑色顆粒大部分是細胞碎片和細胞代謝產物，通過處理可以去除一部分碎片，但細胞只要在生長代謝及傳代，就會有部分細胞死亡裂解產生碎片，該情況一直會存在，可以對比不同細胞庫照片觀察細胞代謝產物情況。
貼壁細胞可以先吸走培養基后用PBS潤洗清除，再加新的培養基繼續培養。潤洗不能清除的可以換液清洗后等細胞密度70-80%左右消化處理細胞，消化完成后加*培養基終止消化，混勻細胞，收集細胞懸液900-1000rpm(約150g)離心3min，棄上清。再加5ml PBS重懸細胞，再離心后，用*培養基重懸接種到新的培養皿。第二次PBS重懸是為了去除碎片，如果平時碎片比較少，傳代時可以省略PBS重懸的步驟；如果碎片很多，建議PBS多洗幾次。
懸浮細胞可以直接收集細胞懸液900-1000rpm(約150g)離心3min，棄上清。再加5ml PBS重懸細胞，再離心后，用*培養基重懸接種到新的培養皿。