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液相色譜柱的系統由儲液器、泵、進樣器、色譜柱、檢測器、記錄儀等幾部分組成。儲液器中的流動相被高壓泵打入系統，樣品溶液經進樣器進入流動相，被流動相載入色譜柱(固定相)內，由于樣品溶液中的各組分在兩相中具有不同的分配系數,在兩相中作相對運動時，經過反復多次的吸附-解吸的分配過程，各組分在移動速度上產生較大的差別，被分離成單個組分依次從柱內流出，通過檢測器時，樣品濃度被轉換成電信號傳送到記錄儀，數據以圖譜形式打印出來。
色譜柱按用途可分為分析型和制備型兩類，尺寸規格也不同:①常規分析柱(常量柱)，內徑2~5mm(常用4.6mm，國內有4mm和5mm)，柱長10~30cm;②窄徑柱(narrowbore，又稱細管徑柱、半微柱semi-microcolumn)，內徑1~2mm，柱長10~20cm;③毛細管柱(又稱微柱microcolumn)，內徑0.2~0.5mm;④半制備柱，內徑>5mm;⑤實驗室制備柱，內徑20~40mm，柱長10~30cm;⑥生產制備柱內徑可達幾十厘米。柱內徑一般是根據柱長、填料粒徑和折合流速來確定，目的是為了避免管壁效應。
液相色譜柱的安裝技巧：
1、首先應確認柱和儀器的接頭以及管路是否匹配。為減少死體積，進樣閥、柱子、檢測器之間的連接管路內徑盡可能使用內徑較小的管線，同時控制進樣器、色譜柱和檢測器之間連接管線的長度。安裝色譜柱之前，確認流路系統中的溶劑是否正常。對分析較復雜的樣品建議安裝保護柱。
2、為了使色譜柱與儀器系統達最佳的連接效果，應盡量使用與色譜柱接口相匹配的螺帽和錐形接頭，如原來的接頭長期匹配其他類型的色譜柱，建議在連接新色譜柱前應檢查匹配情況，避免造成色譜柱的損壞或因色譜柱不匹配造成的漏液。
3、使用PEEK材料的通用接頭，只需用手擰緊不需要特定扳手，使用壓力為5000psi;使用溫度不得超過100℃。
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