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DNA基因合成儀主要用于基因合成、構建克隆及基因組變體文庫合成，按用途可以分為三類：
工業型合成儀合成通量較大，主要用于大型生物實驗室以及商業機構中；
實驗室型合成儀合成通量較小，主要用于生物實驗室中；
大規模合成型合成儀可進行規模化量產，主要用于生物醫藥原料藥制備領域。隨著基因治療以及生物醫藥行業快速發展，預計未來工業性以及大規模合成型DNA合成儀需求增速將加快。
DNA基因合成儀合成產物的回收純化方式：
合成儀上合成的粗產物，使用濃氨水將寡核苷酸鏈從載體CPG上化學切割下來并脫去堿基環上的保護基團，再使用各種純化方式去除合成過程中形成的短片段，得到合乎要求的DNA片段。合成后的處理步驟：
1.切割：將合成好的寡核苷酸鏈從支持物上化學切割下來。
2.脫保護基：須在此步前選好后續的純化方法。一般用新鮮的濃氨水處理較長時間以脫掉腈乙基、苯甲酰基、異丙基，用三氟乙*脫5’-DMT.
3.純化：根據所合成寡核苷酸的組成和應用來選定純化的方法。
4.定量：根據寡核苷酸在260nm處的紫外吸收來定量。
5.儲存：需要注意的是避免紫外線等劇烈的物理環境，避免反復凍融，-20℃可穩定保存一年以上。
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