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BOD測定儀采用微生物電法，將微生物膜緊貼在譜式溶解氧電的透氧膜表面，即構成微生物電。
儀器采用流通測量方式，即樣品以流動方式通過微生物電微生物膜里含有大量好氧微生物，在有氧和有機物的環境下非常活躍，氧電的輸出電流與溶解氧的濃度成正比，不含有機物的液體通過流通池時，透過微生物膜的溶解氧幾乎沒有減少。
當含有有機物的溶液經過流通池時，微生物消耗大量的溶解氧，消耗的溶解氧與有機物的濃度成正比，于是導致透過微生物膜的溶解氧相應減少。溶解氧電測出溶解氧濃度的變化量，從而計算出BOD值。
BOD儀器是基于國家環境保護標準所研制的相關測量儀器，在本試驗中對3種水體BOD樣品進行了基于BOD快速測定儀的質控標準測定，其所測量的準確度相對誤差均在0.5%～5.0%范圍內，這表明BOD快速測定儀的水中BOD樣品測量準確度處于較高水平。
像生活污水、地表水、工業廢水這些實際樣品，在利用BOD快速測定儀在對它們進行測定時發現，機械加工工業廢水在測試過程中存在檢測結果偏差。
這就表明BOD測定儀中的微生物傳感器對機械加工工業廢水檢測是存在局限性的，這是由于工業如石油類、重金屬類等化工物質會對微生物膜菌產生毒害效果，從而強烈干擾檢測效果。
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