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真空冷凍干燥機的冷凍干燥是指通過升華從凍結的生物產品中去除水分或其他溶劑的過程。升華指的是溶劑，比如水，像干冰一樣，不經過液態，從固態直接變為氣態的過程。真空冷凍干燥機冷凍干燥得到的產物稱作凍干物，真空冷凍干燥機該過程稱作凍干。傳統的干燥會引起材料皺縮，破壞細胞。在冰凍干燥過程中樣品的結構不會被破壞，因為固體成份被在其位置上的堅冰支持著。在冰升華時，它會留下孔隙在干燥的剩余物質里。這樣就保留了產品的生物和化學結構及其活性的完整性。
真空冷凍干燥機的常見問題解答：
1、問：為什么在玻璃罩和冷阱之間上下是連通的情況下物料溫度與冷阱溫度在工作時還相差那么大？
答：因為在真空狀態下，熱量已經不能通過空氣傳導了。
2、問：為什么在抽真空過程中壓縮機也要一直開著？
答：因為這樣保持低溫狀態有利于樣品內水分結冰后持續升華過程中產生的水汽在冷阱內再次結冰保存，等凍干完成再除霜。
3、問：為什么凍干將要結束時物料溫度與外界環境溫度差不多甚至還高點？
答：雖然里面的熱量在真空下不能通過空氣上下傳遞，但料盤、隔板和外罩都是連接在一起的。它們能自己傳熱。另外，機器本身可以產生一部分熱量，所以物料溫度就來自于此。冷阱溫度也是由壓縮機作用在冷阱壁上引起的。
4、 問：可以憑借物料溫度來判定凍干終結時間嗎？
答：不可以。需要根據經驗確定合適的凍干時間，因為物料溫度只代表探頭傳感器溫度，可能與實際情況有誤差。但是，材料的溫度可以作為輔助判斷條件。畢竟，只有當材料中水的升華速度不足以抵消環境溫度的升高時，材料的溫度才會開始緩慢上升。
5、問：后凍干結束要化霜時還需要一直開著壓縮機嗎？
答：真空冷凍干燥機凍干結束后壓縮機要先關閉然后再按化霜鍵才能按動，否則一直開著壓縮機，冷阱內溫度不上升冰也不會化。
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