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Raptor核殼分析柱是色譜分析過程中重要的部分，相當于人體的“心臟”。根據自己要分析的樣品去選擇合適的液相色譜柱，需要考慮不同參數將會造成什么影響，比如粒徑、酸堿性、極性和分子量大小等。
Raptor核殼分析柱的儲存液無特殊說明，均為評價報告所示的流動相。在使用前，一定要注意液相色譜柱的儲存液與要分析樣品的流動相是否互溶。在反相色譜中，如用高濃度的鹽或緩沖液作洗脫劑，應先用10％左右的低濃度的有機相洗脫劑過渡一下，否則緩沖液中的鹽在高濃度的有機相中很容易析出，堵塞色譜柱。
即使是液相色譜柱也分很多類型，比如正相、反相、C18柱、親水性色譜柱等等。只有了解影響分析柱性能的因素，才能結合目標分析物的性質、需要達到的分析效果及實驗室條件來選擇適合的色譜柱。
流動相中所使用的各種有機溶劑要盡可能使用色譜純，配流動相的水要是超純水或全玻璃器皿的雙蒸水。如果將所配得流動相再經過0.45μm的濾膜過濾一次則更好，尤其是含鹽的流動相。另外，裝流動相的容器和色譜系統中的在線過濾器等裝置應該定期清洗或更換。
樣品也要盡可能清潔，可選用樣品過濾器或樣品預處理柱（spe）對樣品進行預處理；若樣品不便處理，要使用保護柱。在用正相色譜法分析樣品時，所有的溶劑和樣品應嚴格脫水。
如色譜柱要長時間保存，要存于合適的溶劑下。對于反相柱可以儲存于純甲醇或乙腈中，正相柱可以儲存于嚴格脫水后的純正己烷中，離子交換柱可以儲存于水（含防腐劑*或柳硫汞）中，并將購買新色譜柱時附送的堵頭堵上，儲存的溫度要是室溫。
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