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通用型氣相色譜儀在水質監測化學污染物的檢測領域中，主要用于有機氯農藥、有機磷農藥、有機化學污染物及微量金屬元素的監測。氣相色譜儀在有機氯農藥的檢測中的應用。有機磷農藥多為磷酸酯類或硫代磷酸酯類，有機磷農藥多為油狀液體，工業品呈淡黃至棕色，具有大蒜臭味。一般不溶于水，而溶于有機溶劑及動植物油，對光、熱、氧均較穩定，遇堿易分解破壞。有機磷農藥可經消化道、呼吸道及完整的皮膚和粘膜進入人體。
與氣相色譜法相比，優點是樣品的適用范圍寬。氣相色譜法雖然也具有快速、分離效率高、樣品用量少等優點，但分析的樣品必須能夠氣化。在所有的化合物中可以直接用氣相色譜法分析的物質只占約20%。而液相法只要求樣品能制成溶液而不需要氣化，因此不受樣品揮發性和熱穩定性限制。
通用型氣相色譜儀能用液相進行分析的物質占有機物總量的75-80%。因液相具有適用范圍廣、分率高、速度快、靈敏度高、流動相可選擇范圍寬、色譜柱可反復應用、流出組分容易收集、安全及操作自動化程度高等特點。
應用范圍很廣闊，主要在食品、化工、環保、科學、制藥、生物、衛生等領域，下面我們逐一介紹一下。食品行業主要是微生物飲料中數量組分的分析研究；石油化工、石油地質、油品組成等分析控制和控礦研究；大氣水源等污染地的痕量毒物分析、監測和研究；*事檢測控制和研究；中西藥物：原料中間體及成品分析；臨床應用，病理和毒理研究；勞動保護公害檢測的分析和研究；有機化學： 有機合成領域內的成份研究和生產控制。
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