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芽孢是一種特殊的結構，它形成的體質具有很強的折光性，為了避免不利的環境，不易著色。它在結構和化學成分上與無性系細胞不同，具有許多不同于無性系細胞的特點。對高溫、紫外線、干燥、電離輻射和許多有毒化學物質有很強的抵抗力，被稱為生物界中最抗壓的生物體。
芽孢難以殺死的原因是它的特殊結構。芽孢賦予細菌對各種物理和化學因素（如熱、干燥、輻射、化學消毒劑等）的強大抵抗力，使細菌能夠在惡劣的環境中保持長期活性。如果消毒不*，在適當的條件下，芽孢可以還原成細菌。它從外到內的結構是這樣的。重要的是：它由芽孢壁、芽孢膜、芽孢物質和核區四部分組成，含水量極低。
1、芽孢外壁：主要由脂蛋白組成，通透性差。
2、芽孢外皮：主要含有疏水性的角蛋白。
3、皮層。皮層非常厚，約占芽孢總體積的一半。它主要含有芽孢的肽聚糖和DPA-CA，使芽孢具有異常的耐熱性。皮層的滲透壓非常高。
芽孢的存在足以構成一個重要的因素，威脅到清潔區的微生物驗證的不符合性。芽孢是否能被殺死是衡量各種消毒和滅菌的最重要指標。
實驗室芽孢消毒劑使用的氧化劑是過氧化氫，它與穩定劑結合形成復合溶液。加入的微量銀離子作為催化劑可以保持長期的有效性。銀離子的殺菌作用是基于單價銀離子通過共價鍵和配位鍵與細菌蛋白質牢固結合，使細菌失活或沉淀。從而達到*殺菌的效果，并可取代現有的甲醛熏蒸。
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